DeePMD-kit是一个强大的开源软件包,它使用被称为深度势能模型(DeepPotential,简称DP)的机器学习势能(MLP)来促进分子动力学模拟。该软件包于2017年发布,并广泛应用于物理学、化学、生物学和材料科学领域,用于研究原子尺度体系。DeePMD-kit的当前版本提供了许多先进功能,如DeepPot-SE模型、基于注意力机制的描述符、混合...
DeePMD-kit是一款用深度学习做分子动力学模拟的开源软件包,通过神经网络拟合第一性原理的计算结果来完成精确的量子化学计算,并可以配合分子动力学软件来完成最终的分子动力学模拟。 DeePMD-kit使用的神经网络比较小,计算速度非常快,并且可以保持第一性原理的计算精度,此外模型的设计使其能更好地进行分布式计算,因此可以完...
DeePMD-kit 是围绕深度学习分子模拟方法DeepPotential开发的开源科学软件包。发布一年多以来,DeePMD-kit已被国内外多个研究组使用,涉及物理、化学、材料等多个领域。由于应用与开发需求的不断增加,我们决定定期开展使用交流会。在本次交流会上我们将发布和介绍...
欢迎来到lammps加油站，本文将深入浅出地为您介绍如何在Ubuntu系统中安装深度势能（DeepMD）的软件包DeepMD-kit。DeepMD是一种基于机器学习的方法，它可以帮助我们训练出自定义的势函数，解决传统方法中可能存在的势函数缺失问题。DeepMD-kit的安装提供了离线、conda和docker三种方式供选择，本文将重点介绍使用co...
DeepMD-kit软件在科研领域的应用颇为广泛，以化学科学为例，它在探索物质性质和结构方面展现出独特优势。一项研究中，DeepMD-kit结合AIMD技术，对TiO2-H2O界面进行了模拟，揭示了该界面在光催化水全解、UV诱导亲水性、TiO2生物活性等领域的关键作用。传统ab initio分子动力学技术在模拟固液界面时受到计算性能...
DeePMD-kit 是围绕深度学习分子模拟方法DeepPotential开发的开源科学软件包。发布一年多以来,DeePMD-kit已被国内外多个研究组使用,涉及物理、化学、材料等多个领域。由于应用与开发需求的不断增加,我们决定定期开展使用交流会。在本次交流会上我们将发布和介绍DeePMD-kit v1.0版本和基于DeePMD-kit开发的力场生成软件DP-GE...
DeepMD-kit有CPU和GPU两个版本,根据自己需求选择对应的版本: 在控制台输入对应的命令后会自动下载安装,安装过程会下载各种支持软件包,时间相对较长,耐心等待安装完成。 CPU版本: (base)$condacreate-ndeepmddeepmd-kit=*=*cpulibdeepmd=*=*cpulammps-chttps://conda.deepmodeling.org ...
DeePMD-KIT是一个用Python/C++编写的软件包,可用于建立基于深度学习的原子间势能和力场模型以及执行分子动力学模拟,旨在最大限度地减少科研人员所需的工作量。该软件包的发布为解决分子模拟中精度与效率的两难困境带来了新的希望。DeePMD-KIT的应用范围从有限分子到扩展系统,从金属系统到化学键合系统。DeePMD-KIT与最流...
@曾晋哲总结了直接使用DeePMD-kit完成的工作：https://deepmodeling.com/blog/papers/deepmd-kit/和直接...