一、 DAP-seq技术简介 DAP-seq(DNA亲和纯化测序)技术服务——高通量检测转录因子或DNA结合蛋白在基因组上的结合位点。 在功能基因组学和表观遗传学研究中,转录因子结合位点(TFBS)的发掘一直是研究热点。传统的ChIP-seq(染色质免疫共沉淀测序)方法,在抗体质量很好的情况下能够有效检测到TFBS。然而,好的抗体可遇不可...
DAP-Seq(DNA亲和纯化测序) | 传统的ChIP-seq 是进行体内检测 TFBS 的主要方法,繁琐步骤和材料需求阻拦了很多科研进程。DNA亲和纯化测序方法,成功将体内结合实验转移到体外,解决了ChIP抗体制备的困扰,极大的提高 DNA Binding Site发现的效率。 DAP-seq不仅能够超高通量查找TFBS,还能深入了解众多TF的生物学特性和结合位...
3.如权利要求2所述表观遗传的dap-seq测序建库方法,其特征在于,步骤(4)中的pfn19kt7sp6vector质粒是用致死基因ccdb替换了原有的致死基因barnase,同时在ccdb两端引入hindiii和ecorv两个酶切位点,改进获得的。 4.如权利要求2所述表观遗传的dap-seq测序建库方法,其特征在于,步骤(7),步骤(9)及步骤(11)中的液体...
摘要:Opaque2(O2)是一个调控玉米胚乳发育的重要转录因子.为了揭示O2的转录调控网络,利用DAP-Seq技术挖掘其在全基因组范围上结合位点共检测到11385个位点.通过结合已报道RNA-Seq数据,本研究DAP-Seq共检测到317个O2直接结合并调控的靶基因,其中包括97个已报道ChIP-Seq检测靶基因以及220个DAP-Seq特异检测的靶基因.而...
一种融合转座酶建库的DAP-seq实验方法专利信息由爱企查专利频道提供,一种融合转座酶建库的DAP-seq实验方法说明:本申请公开了一种融合转座酶建库的DAP‑seq实验方法,利用Tn5转座酶结合未被转录因子(TF)结合...专利查询请上爱企查
摘要: 本发明属于高通量测序建库领域,具体涉及一种表观遗传的DAPseq测序建库方法.本发明提供的测序建库方法主要包括载体构建,TF体外表达预实验及DAPseq建库等过程.本发明提供的测序建库方法可以直接使用从细胞中提取的基因组DNA与目标TF结合,从而可以保留基因组DNA修饰,与现有技术相比,更接近体内试验....
DAP-seq:转录因子结合位点研究新方法 DAP-Seq将蛋白质体外表达技术与高通量测序技术相结合,不需要针对每个转录因子制备特异性抗体,所以DAP-Seq具有快速、高通量、节约时间成本等显著优势,比ChIP-seq更易于扩展。 DAP-seq:转录因子结合位点研究新方法 产品详情 ...
一种表观遗传的dap-seq测序建库方法,包括如下步骤: s1、构建基因表达载体; s2、tf体外表达预实验; s3、dap-seq建库。 优选地,步骤s1的具体操作如下: (1)根据tf家族的基因序列,设计合成相关基因的引物,得tf引物; (2)用步骤s1获得的tf引物,通过pcr扩增tf基因; ...
一种表观遗传的DAP-seq测序建库方法专利信息由爱企查专利频道提供,一种表观遗传的DAP-seq测序建库方法说明:本发明属于高通量测序建库领域,具体涉及一种表观遗传的DAP‑seq测序建库方法。本发明提供的测...专利查询请上爱企查