DAP-seq分析结果还检测到6507个特有基因的启动子区域中47923个motif序列,其中SlBEL11最显著的结合motif是“TYTTTTTCTTTYT”。 03 转录组+DAP-seq关联 为了进一步确定SlBEL11调控的具体靶基因,将DAP-seq数据与转录组分析结合分析发现,SIBEL11-RNAi敲除株中与SlBEL11结合的有556个上调基因和302个下调基
DAP-seq数据分析的主要目标是鉴定出与特定蛋白结合的DNA序列。这通常包括以下几个步骤: 读段质量控制:过滤低质量的读段。 读段定位:将读段定位到参考基因组上。 峰值检测:在基因组上识别出读段富集的区域,这些区域通常对应于与蛋白结合的DNA序列。 峰值注释:对检测到的峰值进行注释,例如确定它们是否位于基因的启动...
蓝景科信DAP-se..1、DAP-seq在基因组水平上,鉴定转录因子的结合位点(transcription factor binding sites, TFBS)非常重要。ChIP-seq是进行体内检测TFBS的主要方法。
蓝景科信DAP-seq(DNA亲和纯化测序)技术服务实验分析流程 100+物种,1000+转录因子的实战经验。 无需抗体,高通量鉴定转录因子的下游基因,蓝景科信已助力客户在许多期刊发表文章,例如:Molecular Plant,The Plant Cell,Plant Physiology等。 产品介绍: 品牌其他品牌适用领域科研 ...
DAP-seq数据分析参考价订货量 ￥99999 ≥1个 具体成交价以合同协议为准型号 品牌其他品牌 所在地北京市 更新时间2025-05-06蓝景科信河北生物科技有限公司 厂商性质生产厂家 入驻年限第5年 实名认证已认证 产品数量162 人气值166722产品标签 DAP-seq价格周期DNA亲和纯化测序DAP-seq技术服务DAP-seq实验流程DAP-seq...
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DAP-seq实验流程 | 组织材料:基因组DNA提取--->gDNA⽚段化--->DAP library---| 转录因⼦:构建蛋⽩表达载体体外蛋⽩表达 ⽂库蛋⽩结合--->亲和纯化--->结合⽂库洗脱--->终⽂库扩增--->上机测序--->数据分析 #表观遗传学 发布
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至于「MACS2 GUI Wrapper」,这个插件出现后,可以让所有「TBtools」用户轻松在不同平台,如「Windows」或者「MacOS」上,从原始测序数据到 Peaks,自主完成分析。相比于其他所有解决策略,「TBtools」是最为简单的本地化分析策略,只要你有数据,也有安装「TBtools」就可以,一键安装插件,一键完成分析。