DAP-seq(DNA Adenine Photobase Editor sequencing)是一种结合了光遗传学、CRISPR-Cas系统和高通量测序的技术,用于研究DNA序列特异性的蛋白-DNA相互作用。以下是对DAP-seq数据分析的详细解答,按照你的提示进行组织: 1. 理解DAP-seq技术的原理 DAP-seq技术利用光遗传学工具在特定波长光的照射下,诱导CRISPR-Cas系统对...
DAP-seq分析结果还检测到6507个特有基因的启动子区域中47923个motif序列,其中SlBEL11最显著的结合motif是“TYTTTTTCTTTYT”。 03 转录组+DAP-seq关联 为了进一步确定SlBEL11调控的具体靶基因,将DAP-seq数据与转录组分析结合分析发现,SIBEL11-RNAi敲除株中与SlBEL11结合的有556个上调基因和302个下调基因,这些重叠基...
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至于「MACS2 GUI Wrapper」,这个插件出现后,可以让所有「TBtools」用户轻松在不同平台,如「Windows」或者「MacOS」上,从原始测序数据到 Peaks,自主完成分析。相比于其他所有解决策略,「TBtools」是最为简单的本地化分析策略,只要你有数据,也有安装「TBtools」就可以,一键安装插件,一键完成分析。
DAP-seq具有与ChIP-seq同样的功能。通过体外蛋白表达技术,表达出带有标签的转录因子,和基因组DNA文库在体外进行结合,然后分离出所有与转录因子结合的DNA,再使用高通量测序,找到转录因子的结合位点。2、DAP-seq和ChIP-seq的特点3、关于蓝景科信蓝景科信提供DAP-seq全流程技术服务+个性化数据分析,与中国科学院、中国农业...
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公示项目名称DAP-seq数据分析 用户单位名称***联系人/电话钟**/159***0280 采购计划预算(4600-223579)国家高层次人才项目(青年项目)-钟晋顺采购计划单号SQ***1877 项目需求DAP-seq测序相关数据测试分析结果 预算测算依据1例单价为4640元 推荐承办单位名单及承办价格 承办单位...
DAP-seq实验流程 | 组织材料:基因组DNA提取--->gDNA⽚段化--->DAP library---| 转录因⼦:构建蛋⽩表达载体体外蛋⽩表达 ⽂库蛋⽩结合--->亲和纯化--->结合⽂库洗脱--->终⽂库扩增--->上机测序--->数据分析 #表观遗传学 发布
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