文章综合重测序、转录组和DAP-seq三个技术构建了以zbed1为中心SSD调控机制。 图2 A. GWAS分析的曼哈顿图;B.25个相关基因的表达量热图,FP,雌性垂体, FB,雌性大脑,FG,雌性性腺,FL,雌性肝,MP,雄性垂体,MB,雄性大脑,MG,雄性性腺,ML,雄性肝;C. DAP-seq各个染色体的peak数目;D. DAP-seq的peak相关基因的GO富集...
转录因子参与种子萌发、生长和发育、开花、衰老以及抗逆,寻找转录因子下游靶基因,探究其调控机制并绘制调控网络一直是植物领域的热门研究方向之一。ChIP-seq和DAP-seq是目前常用的蛋白质与DNA互作研究方法,两种…
研究发现，转录因子MeGI通过调控昼夜节律、水杨酸生物合成和类黄酮生物合成途径中的基因，影响油柿的性别控制功能。该研究使用ChIP-seq、DAP-seq、RNA-seq和EMSA等技术，结合油柿和拟南芥的实验，揭示了MeGI的调控机制。油柿MeGI基因能抑制拟南芥雄蕊的发育，通过ChIP-seq、DAP-seq和RNA-seq的联合分析，鉴定出...
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在本研究中,作者以转录因子MeGI为切入点,主要通过ChIP-seq、DAP-seq、RNA-seq等多组学技术联合分析,以此探究MeGI的调控机制,并提出一种MeGI介导的油柿性别决定模型。本研究为人工诱导优良雄性柿种质资源、高效杂交育种选育新的柿品种提供了理论依据。 图9 MeGI介导的油柿性别决定模型 ...
作者通过zbed1的体外表达进行DAP-seq,共得到1352个peak,并主要分布在第1、14、8号染色体上,peak相关基因富集到轴突导向和再生、hippo信号通路、细胞周期等通路,并可在转录组数据中检测到高表达,camsap1更是在GWAS中与显著SNP相关的基因。文章后续通过MEME对zbed1的motif结构进行了分析。文章综合重测序、转录组和DAP-...