基于DAP-seq数据中的结合峰值、荧光素酶报告实验(DLRA)、凝胶阻滞实验(EMSA),说明了与PtoWRKY68hap2相比,PtoWRKY68hap1对靶基因的启动子具有更高的亲和力。干旱胁迫下与WT和PtoWRKY68hap2OE相比,在PtoWRKY68hap1OE中AtABF2和AtRD26的表达水平显著升高,AtDTX50的表达水平则明显降低。ABA敏感性实验说明PtoWRKY68等...
该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq) 技术鉴定了木薯中转录因子MeTGA2的结合基序、预测了其靶点。进一步研究揭示了MeGRXC3调控过氧化氢酶活性响应植物干旱胁迫的分子机制,为利用基因工程策略开发抗旱高产木薯新品种提供了宝贵的基因资源。 谷氧还蛋白(GRXs)在植物响应环境变化的活性氧(ROS)稳态中发挥至关重要的作用。
DAP-seq鉴定了MdWRKY115的结合元件是W-box基序(核心序列是TTGAC)。通过对MdWRKY115结合位点的筛选发现,胁迫相关基因MdRD22是MdWRKY115的潜在靶基因。电泳迁移率测定(EMSA)验证了MdWRKY115与MdRD22启动子的特异性结合。此外,通过检测转基因苹果愈伤组织发现,过表达MdWRKY115基因能够促进MdRD22的表达。这些结果表明,MdW...
DAP-seq的全称是DNAaffinity purification sequencing,即DNA亲和纯化测序,该技术通过体外表达转录因子鉴定转录因子结合位点(Transcription factor binding site,TFBS),不受抗体和物种限制,且具有高通量的优势,该技术自问世以来,已被广泛应用于转录调控和表观组学的研究。 DAP-Seq将蛋白质体外表达技术与高通量测序技术相结合...
基于DAP-seq数据中的结合峰值、荧光素酶报告实验(DLRA)、凝胶阻滞实验(EMSA),说明了与PtoWRKY68hap2相比,PtoWRKY68hap1对靶基因的启动子具有更高的亲和力。干旱胁迫下与WT和PtoWRKY68hap2OE相比,在PtoWRKY68hap1OE中AtABF2和AtRD26的表达水平显著升高,AtDTX50的表达水平则明显降低。ABA敏感性实验说明PtoWRKY68等...
基于DAP-seq数据中的结合峰值、荧光素酶报告实验(DLRA)、凝胶阻滞实验(EMSA),说明了与PtoWRKY68hap2相比,PtoWRKY68hap1对靶基因的启动子具有更高的亲和力。干旱胁迫下与WT和PtoWRKY68hap2OE相比,在PtoWRKY68hap1OE中AtABF2和AtRD26的表达水平显著升高,AtDTX50的表达水平则明显降低。ABA敏感性实验说明PtoWRKY68等...
DAP-seq技术在研究谷氧还蛋白MeGRXC3调控木薯响应干旱胁迫 分子机制中的应用 木薯(Manihot esculentaCrantz)是一种重要的热带作物,是热带和亚热带干旱地区的主要粮食作物之一。干旱胁迫严重影响木薯的产量和品质。鉴定木薯中重要的抗旱基因,对于培育抗旱高产木薯新品种具有非常重要的意义。
DAP-seq鉴定了MdWRKY115的结合元件是W-box基序(核心序列是TTGAC)。通过对MdWRKY115结合位点的筛选发现,胁迫相关基因MdRD22是MdWRKY115的潜在靶基因。电泳迁移率测定(EMSA)验证了MdWRKY115与MdRD22启动子的特异性结合。此外,通过检测转基因苹果愈伤组织发现,过表达MdWRKY115基因能够促进MdRD22的表达。这些结果表明,Md...
(a) 酵母双杂交实验表明MeGRXC3与MeTGA2相互作用。(b) 双分子荧光互补实验表明在烟叶中MeGRXC3与MeTGA2可以在体内相互作用。(c) 在酵母中MeTGA2具有转录激活活性。(d) DAP-seq鉴定了木薯MeTGA2结合的motif。(e) 基于DAP-seq分析,鉴定了木薯中MeTGA2的靶点基因。