DAP-seq,即DNA亲和纯化测序技术,是一种专门用于研究蛋白质-DNA相互作用的高通量方法。以下是对DAP-seq的详细介绍:
DAP-seq的原理是通过体外表达的蛋白和DNA进行亲和纯化,将结合的DNA洗脱后进行高通量测序。简单来说,就是先让蛋白和DNA在体外结合,然后分离出这些结合了的DNA,再进行测序分析。
DAP-seq的全称是DNAaffinity purification sequencing,即DNA亲和纯化测序,该技术通过体外表达转录因子鉴定转录因子结合位点(Transcription factor binding site,TFBS),不受抗体和物种限制,且具有高通量的优势,该技术自问世以来,已被广泛应用于转录调控和表观组学的研究。DAP-seq实验原理 体外表达的蛋白和DNA进行亲和...
DAPSeq的基本原理是将DNA提取、裂解、甲基化处理后,通过测序技术对其进行分析,从而确定DNA甲基化谱。 DAPSeq的实验流程主要包括DNA提取、酶切、甲基化、测序和数据分析等步骤。首先,需要从样品中提取DNA,然后对其进行酶切,将DNA分成适当的片段。接着,对DNA片段进行甲基化处理,以模拟真实的DNA甲基化状态。甲基化后的...
一、DAP-seq的原理是什么?实验流程概述? 可以分为以下三个阶段 转录因子的无细胞表达 1、将转录因子TF蛋白连上一个Halo 标签,这个标签大概33kd,通过无细胞表达的方式,将Halo-TF融合蛋白表达出来,再进一步借助Western Blot实验用Halo标签抗体检测是否成功表达。
🔍 DAP-seq实验原理 在DAP-seq实验中,体外表达的蛋白与DNA进行亲和纯化,将与蛋白结合的DNA洗脱后进行高通量测序。具体步骤包括:将编码转录因子的CDS序列构建到含有亲和标签(如Halo-Tag)的载体中,形成转录因子和亲和标签的融合蛋白;提取样品的基因组DNA,构建DNA文库;然后将体外表达的带有亲和标签的转录因子与DNA文库...
DAP-seq 实验原理 体外表达的蛋白和 DNA 进行亲和纯化,将与蛋白结合的 DNA 洗脱后进行高通量测序。其基本过程是将编码转录因子的 CDS 序列构建到含有亲和标签(Halo-Tag)的载体中,构建蛋白表达载体,进行体外蛋白表达,形成转录因子和亲和标签的融合蛋白;提取样品的基因组 DNA,构建 DNA 文库,然后将体外表达的带有亲和...
ChIP-seq/DAP-seq/CUT&Tag的原理都可以归纳为目标蛋白在基因组某个位点结合后,含有该位点的DNA片段将会被选择性富集;测序之后,来自于此DNA片段的reads较其他非蛋白结合的DNA片段reads多,在数据可视化上呈现一个堆集起来的山峰(在计算机概念上叫“peak”)。ATAC-seq的原理则是利用Tn5转座酶特异性识别染色质开放区...
DAP-seq实验原理 100+物种,1000+转录因子的实战经验。 DAP-Seq将蛋白质体外表达技术与高通量测序技术相结合,不需要针对每个转录因子制备特异性抗体,所以DAP-Seq具有快速、高通量、节约时间成本等显著优势,比ChIP-seq更易于扩展。 产品介绍: 品牌其他品牌