在进行CUT&Tag实验时，首先将细胞与磁珠混合，然后进行靶蛋白特异性抗体（一抗）孵育，使抗体进入细胞与靶蛋白结合。为了放大信号，接着进行二抗孵育。最后孵育pAG-Tn5转座体，使得转座体进入细胞并与抗体结合，这样就把转座体间接的固定在靶蛋白上，随后加入Mg²⁺，激活Tn5酶的切割活性，打断靶蛋白结合的DNA区域。
5、快速、简化的程序: 从细胞到文库DNA的过程不到5小时。 6、非常方便:该试剂盒包含CUT&Tag原位测序每个步骤所需的所有组件,足以用于蛋白质/DNA捕获和捕获的DNA文库制备,从而使cTIP(CUT&Tag In-Place)测序试剂盒Z方便,结果可靠且一致。 CUT&Tag试剂盒反应图示: DNA-Target Protein-Antibody-ChipTag结合示意图...
5. PCR扩增条件:优化PCR扩增条件,以确保扩增效率和特异性。 6.文库构建和测序:按照建库试剂盒和测序平台的说明书进行操作,确保实验结果的准确性和可靠性。 CUT&Tag技术是一种高效、灵敏的蛋白质-DNA互作关系研究方法,但在实验过程中需要注意细节,以确保实验结果的准确性和可靠性。©...
6、高度方便:试剂盒包含CUT&Tag就地测序的每个步骤所需的所有组分,这些组分足以进行蛋白/DNA捕获和捕获的DNA文库准备,从而使cTIP(CUT&Tag In-Place)测序试剂盒成为Z方便、可靠且结果一致的试剂盒。 CUT&Tag试剂盒检测原理: EpiNext™ cTIP(CUT&Tag In-Place)测序试剂盒包含了从哺乳动物细胞开始进行成功的cTIP-...
nohup ParaFly-cmap.sh-CPU10 用建库试剂盒给的spike in序列构建索引,spike in DNA比对bowtie2-build Ecoli_904.fasta./E.coli_index mkdir-p/home/zyn/zbw_cut-tag/3.map/bowtie2_result spikeinref="/home/zyn/zbw_cut-tag/3.map/E.coli_index/E.coli_index"cat./sample.txt|whilereadid;do echo...
CUT&Tag技术以其高灵敏度、低背景、简便快捷的操作流程在组蛋白修饰分析中占有一席之地。它特别适合于样本量有限的情况,并且能够提供高分辨率的数据。 珠海舒桐医疗科技有限公司推出的GeneRulor pA-Tn5 Transposome可以有效地进行CUT&Tag,同时公司还推出了CUT&Tag试剂盒,本CUT&Tag试剂盒相较于传统的ChIP-seq,优化了...
CUT&Tag-IT™ Assay Kit是否有任何建议的质量控制步骤? 文库生成后,成功的文库制备质量应通过TapeStation 或 Bioanalyzer来评估。一个理想文库的片段大小大部分是低于500 bp的。我们建议使用KAPA文库定量试剂盒测定文库浓度。 Q11 CUT&Tag是否需要像ChIP-Seq一样的Input对照?
1、阳性抗体对照:CUT&Tag3.0试剂盒配有经过验证的H3K4me3兔源一抗、二抗,帮助排查实验体系问题,辅助实验员优化实验体系,以获取较好的实验结果。 2、片段化DNA提取磁珠:CUT&Tag3.0试剂盒配有片段化DNA提取磁珠,可以完整回收实验中打断...
该流程兼具ChIP-seq用甲醛交联可有效固定蛋白的优点和CUT&Tag技术细胞用量少、操作简单、信噪比高的优点,为转录因子、辅因子及其他结合力较弱的DNA结合蛋白互作研究提供了一种新的思路。 经典CUT&Tag步骤与fcCUT&Tag实验流程图 CUT&Tag® 4.0 试剂盒亮点 ...