而且CUT&Tag实验中细胞被固定在磁珠上,整个过程在一根EP管里进行,标记步骤包括染色质剪切和同时插入测序文库接头,适合于高通量实验甚至单细胞实验(scCUT&Tag)。 测序量少 CUT&Tag实验中,最后一步提取的染色质位于兴趣蛋白结合位点附近,分离出的较短DNA序列意味着它没有ChIP-Seq那样的深度测序要求。 对于CUT&Tag技术...
尽管CUT&Tag与ChIP方法在某些方面类似,但CUT&Tag实验的起始材料是活的可渗透细胞或分离的细胞核,而不是ChIP中使用的甲醛交联的细胞或组织。 在CUT&Tag实验中,细胞首先被通透化,并与固定在伴刀豆凝集素A(ConA)涂层磁珠上的抗体一起孵育。该磁珠抗体可便于后续的清洗步骤。接下来,细胞与目标蛋白特异性抗体孵育,然后...
尽管CUT&Tag与ChIP方法在某些方面类似,但CUT&Tag实验的起始材料是活的可渗透细胞或分离的细胞核,而不是ChIP中使用的甲醛交联的细胞或组织。 在CUT&Tag实验中,细胞首先被通透化,并与固定在伴刀豆凝集素A(ConA)涂层磁珠上的抗体一起孵育。该磁珠抗体可便于后续的清洗步骤。接下来,细胞与目标蛋白特异性抗体孵育,然后...
CUT&Tag技术应用于空间组学领域仍属于新尝试。 自CUT&Tag技术问世以来,越来越多被应用于热门前沿研究中,如单细胞领域等;想必越来越多的研究者正期望着快速掌握CUT&Tag技术! 因此,Active Motif推出的CUT&Tag完整解决方案来为大家助力了: CUT&Tag完整解决方案 ○pA-Tn5酶 ○CUT&Tag级的抗体 ○CUT&Tag试剂盒 ○CU...
一、CUT&Tag技术发展历程 ChIP-Seq (Chromatin Immunoprecipitation Sequencing) 因能真实、完整地反映靶蛋白与DNA序列的结合情况,因而成为一直以来研究DNA-蛋白相互作用的经典方法。但ChIP-Seq继承了ChIP的难点与局限性:需要大量细胞投入(10...
CUT&Tag是在未固定细胞或细胞核上进行的,避免了标准ChIP工作流程中的固定、染色质制备和超声处理步骤。超声波处理的设置非常具有挑战性,需要昂贵的专用设备。此外,过度固定和过度超声会破坏蛋白质表位,阻止它们被免疫沉淀。有些抗体在自然条件下效果更好。
诺禾致源CUT&Tag测序项目,通过对获得的高质量reads,进行Peak calling及motif分析,高效预测相关基因, 进行功能富集分析、预测特异蛋白的功能,组蛋白染色体结合图谱以及DNA的表观修饰。 关联分析 送样建议 注:抗体浓度需≥0.2μg/μl,若低于0.2μg/μl,需进行抗体评估。
CUT&Tag是蛋白质与DNA互作的革新技术,无需通过甲醛交联以及免疫共沉淀,其核心技术为pA/G-Tn5 Transposase,将Protein A/G与Tn5转座酶进行融合,使得与抗体结合的同时,Tn5切割核小体上缠绕的DNA片段,获得目的序列。 图2. CUT&Tag原理图 2)实验流程 利用连有刀豆蛋白A的磁珠(ConA)结合细胞(与细胞膜上的糖蛋白...
CUT&Tag是蛋白质与DNA互作的革新技术,无需通过甲醛交联以及免疫共沉淀,其核心技术为pA/G-Tn5 Transposase,将Protein A/G与Tn5转座酶进行融合,使得与抗体结合的同时,Tn5切割核小体上缠绕的DNA片段,获得目的序列。 图2. CUT&Tag原理图 2)实验流程 利用连有刀豆蛋白A的磁珠(ConA)结合细胞(与细胞膜上的糖蛋白...
1.CUT&Tag 是什么？CUT&Tag 是蛋白质-DNA 互作关系研究的新方法，能在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA片段，是新一代超微量ChIP-Seq技术，适用于无ChIP级别抗体的蛋白研究。CUT&Tag 有望将蛋白与染色质 DNA 互作的研究变成了一种类似 PCR 反应的常规操作，对基因调控、表观遗传等领域的研究...