表1 CUT&Tag与ChIP-seq实验相比具有的优势 CUT&Tag在植物上的应用 2019年Kaya-Okur等人首先在哺乳动物中使用CUT&Tag技术提供了高分辨率测序来分析不同的染色质组分,通过在低样本量和单细胞水平分析组蛋白修饰、RNA聚合酶II和转录因子的表达证明了CUT&Tag技术的实用性 (Kaya-Okur et al., 2019)。这是首次运用CUT...
由于植物存在细胞壁、大液泡以及复杂次生代谢产物,在进行CUT&Tag实验之前,需要分离出高质量的细胞核,所以植物组织中CUT&Tag的应用非常具有挑战性。近日,浙江大学农学院的关雪莹教授团队根据动物细胞中CUT&Tag的实验,开发了一套在植物中进行CUT&Tag的方法,为植物中染色质状态的表观遗传研究提供了一个比ChIP更具优势、...
CleavageUnder Target & Tagmentation(CUT&Tag)是一种新兴的研究DNA-蛋白质互作的方法。2019年，StevenHenikoff团队将该技术首次应用于哺乳动物细胞，在《NatureCommunications》上公布。该方法克服了传统ChIP-Seq技术的很多缺点，省时，操作简便，数据信噪比高，需要的细胞起始量低。除了动物组织，细胞样品，该项技术在植物...
2020年,浙江大学关雪莹团队在Plant Methods发表了题为“Efficient chromatin profiling of H3K4me3 modification in cotton using CUT&Tag”的研究论文,基于动物细胞中CUT&Tag的文库构建方法,作者开发了一套在植物中构建CUT&Tag文库的方法,并比较了棉花叶片CUT&Tag与ChIP-seq的文库构建效率。与ChIP-seq相比,CUT&Tag处理...
除了动物组织,细胞样品,该项技术在植物领域也越来越受到大家的关注和青睐。研发人员对CUT&Tag技术进行改进,打破植物细胞壁、大液泡和次生代谢产物的壁垒,使其能够广泛应用于植物染色质的释放。目前已在棉花,水稻,拟南芥的植物样品中取得成功; 案例一: Efficient chromatin profiling of H3K4me3 modification in cotton usi...
在进行植物样本的CUT&Tag实验时,样本制备可是个大学问!📚首先,制备原生质体是个不错的选择,这样实验就能轻松搞定。不过,不同样本的酶消化时间差别可大了,有时候就算是同一样本,不同组织部位的消化时间也不一样。所以,每个实验室都得根据自己的条件和样本类型来摸索最佳条件。如果...
由于植物存在细胞壁、大液泡以及复杂次生代谢产物,植物组织中CUT&Tag的应用非常具有挑战性。2020年9月,浙江大学农学院的关雪莹课题组以棉花为模型系统,开发了在植物中分离细胞核后进行CUT&Tag实验的方法。研究结果表明,与常规ChIP-Seq相...
CUT&Tag适用于哺乳动物细胞的蛋白-DNA互作研究,酵母、植物等细胞需要经过(破除细胞壁或者提取细胞核)来进行实验。CUT&Tag在哺乳动物细胞系上的应用比较成熟,动物组织经过处理得到悬浮单个细胞同样可以进行实验。 CUT&Tag适用于活细胞,对细胞状态有要求吗? CUT&Tag在活细胞上确实成功率比较高,在准备细胞时需要保证细胞处...
更不要说单细胞技术爆火的现在，scCUT&Tag技术中，各种动物、细胞以及植物的文章见刊，并且CUT&Tag技术还衍生出了多靶标CUT&Tag，实现一个细胞，多个靶标的研究。CUT&Tag技术发展历程2019年4月 首次发表2020年大量组蛋白修饰、少量转录因子研究见刊2021年大量转录因子研究见刊2021年1月 scCUT&tag在动物应用...
诺禾致源CUT&Tag自推出服务以来对多类动植物样本成功建库。对于人、鼠等动物细胞/组织样本积累了大量经验,一抗包括多种组蛋白修饰和转录因子。并且对于部分特殊样本建库进行流程优化,包括细胞低起始量建库和低活性细胞建库实现了技术突破。除了动物样本之外,诺禾...