由于植物存在细胞壁、大液泡以及复杂次生代谢产物,在进行CUT&Tag实验之前,需要分离出高质量的细胞核,所以植物组织中CUT&Tag的应用非常具有挑战性。近日,浙江大学农学院的关雪莹教授团队根据动物细胞中CUT&Tag的实验,开发了一套在植物中进行CUT&Tag的方法,为植物中染色质状态的表观遗传研究提供了一个比ChIP更具优势、...
CUT&Tag技术作为新一代DNA-蛋白质互作研究技术,近年来有了飞速的发展,其应用场景经过多方拓展,目前已应用于医学,动物学,植物学,发育生物学等领域。以其下机数据信噪比高、所需细胞数少(低至60个细胞,甚至可进行单细胞测序)、测序量...
结果表明CUT&Tag产生的信噪比较高(FRiP=0.7;表1)。然而,从H3K4me3信号热图上可以看出,在整个gene body区域CUT&Tag的信号比ChIP-Seq更强(图4,a)。从相关性分析的结果可以看出,基因附近的peaks在CUT&Tag两个生物学重复之间相关性很高(r=0.94,pearson’s correlation;图4,b),CUT&Tag和ChIP之间的相关性也较高(r...
在进行植物样本的CUT&Tag实验时,样本制备可是个大学问!📚首先,制备原生质体是个不错的选择,这样实验就能轻松搞定。不过,不同样本的酶消化时间差别可大了,有时候就算是同一样本,不同组织部位的消化时间也不一样。所以,每个实验室都得根据自己的条件和样本类型来摸索最佳条件。如果你不想制备原生质体,也可以试试将...
CUT&Tag是一种全新的研究DNA与蛋白质互作的技术,可以替代传统的ChIP-Seq,主要用于研究目标蛋白在染色质上的定位,在表观遗传学研究等领域至关重要。 图1 CUT&Tag的基本原理 CUT&Tag使用Protein A与Tn5转座酶的融合蛋白(ChiTag),在抗体的引导下,Protein A与染色质上的目的组蛋白修饰标记、转录因子或染色质调控蛋白...
浙江大学农学院的关雪莹教授团队根据动物细胞中CUT&Tag的方法,开发了一套在植物中进行CUT&Tag的方法,为植物染色质状态的表观遗传研究提供了一个比ChIP更具优势、操作性更强的方法。相关研究成果以“Efficient Chromatin Profiling of H3K4me3 Modification in Cotton Using CUT&Tag”为题发表在Plant Methods上。
近日,浙江省农科院徐盛春研究员及其团队成员开发了生物素标记的Tn5转座酶介导的CUT&Tag (B-CUT&Tag)方法,并成功应用于植物转录因子与DNA互作研究。该技术首次报道了利用CUT&Tag在植物中鉴定转录因子结合位点,提供的B-CUT&Tag流程可以...
植物cuttag (共58件相关产品信息) 更新时间:2024年12月20日 综合排序 人气排序 价格 - 确定 所有地区 实力供应商 已核验企业 在线交易 安心购 查看详情 ￥1.00/株 湖南郴州 道路庭院篱笆围墙 红豆杉 耐寒植物 种类多样 李芳苗圃种植 春色叶 耐寒 郴州市苏仙区李芳草皮苗木种植场 5年 查看详情 ￥4.00/棵...
tsCUT&Tag技术流程概要如下(图1A):先从特定组织中分离植物原生质体,例如玉米黄化苗和水稻绿叶鞘等。将转录因子克隆到pM999-GFP载体中,在分离的原生质体中瞬时表达。收集大约10 5 个成功转染的活细胞,立即固定在ConA Beads上,并用5% Digitonin预处理细胞以结合一抗和二抗以及pG-Tn5转座酶。最后,基于Tn5转座酶酶切和...
CUT&Tag是一项研究DNA-蛋白质互作的新技术，据说在植物上比较难做，有哪位大佬有这方面的经验，还请...