cat /gpfs/home/fangy04/cut_tag/filenames | while read i do awk -v w=$binLen '{print $1, int(($2 + $3)/(2*w))*w + w/2}' $projPath/bed_files/${i}_bowtie2.fragments.bed | sort -k1,1V -k2,2n | uniq -c | awk -v OFS="\t" '{print $2, $3, $1}'| sort ...
单纯跑一遍流程,将就下吧。名字我手动一个个改的,# 没用到啥快捷的方法,搜对应的SRR号可以看到它的实验名,自己手动改下吧)(chipbase)way@TMU-7920:/mnt/8_2/way/cuttagdemo1$ tree
本教程是为了按照Bench top CUT&Tag V.3 protocol处理和分析CUT&Tag数据而设计的。本教程中使用的数据是人类淋巴瘤K562细胞系中组蛋白修饰的图谱,但本教程一般适用于任何染色质蛋白,包括转录因子、RNA聚合酶II和表位标记蛋白。 (三)CUT&Tag数据处理和分析流程 (四)数据下载 我们使用的数据是Kaya-Okur et al. (...
使用MACS2 call peak(RNAPII S2/5p CUT&Tag),并分析通过PRO-seq run-on人类K562细胞(SRA GSM1480327)的数据集。当使用RNAPII CUT&Tag 的MACS2评分排序时,PRO-seq的occupancy和RNAPII- ser2 /5p CUT&Tag的occupancy之间有密切的对应关系(图2e)。 通过CUT&Tag分析的H3K4me1修饰的重复非常相似,证明了该方法的可...
P85405 DOM02的执行顺序 DOM2相对DOM0的优点_ 10:27 P85506 自定义事件_ 33:58 P85607 event对象_ 43:58 P85708 target对象_ 27:48 P85809 阻止默认行为 阻止冒泡_ 20:26 P85910 事件委托_ 17:58 P86001 前奏+完美法则_ 38:22 P86102 tag选择器_ 40:34 P86203 class选择器01_ 31:58 P86304 cl...
Link-Cut Tree 学习笔记 Link Cut Tree 是一种用来维护动态树问题的数据结构。 其维护的是一个森林,森林中的每个树由若干个 Splay 组成,每个 Splay 代表树上的一条链,一个 Splay 的中序遍历就是那条链的顺序。 为了将一棵树分成若干条链,我们引入实链剖分。
在本文中,你可能找到:线段树,可持久化数据结构(主席树等),李超树,K-D Tree,树套树,莫队等算法。 I 树套树 顾名思义,就是一个树套一个树。。。 广义的树套树是指嵌套多层的数据结构。常见的有:线段树套线段树(二维线段树),线段树套平衡树(“二逼平衡树”),
tag[x] 节点x的翻转情况 ch[x][0/1] 节点x的左/右儿子(children) 简介 这里先给出将要介绍的基本操作的用途,看不懂没关系,接下来会图解+代码说明。 操作名称 用途 access(x) 将x到根节点的路径全部变成实边,并把其他子节点的边改为虚边 findroot(x) ...
Cut模型级别智能是Forge Viewer的一个功能,它允许用户在三维模型中进行切割操作,以便更好地观察模型的内部结构或者进行精细的分析。 具体来说,Cut模型级别智能可以实现以下功能: 切割模型:用户可以通过在模型上绘制切割平面,将模型分割成不同的部分,以便更好地观察和分析模型的内部结构。 切割平面控制:用户可以自由调整...
movie follows the protag 分享6323 美国牛仔吧 神枪侠 《牛仔文化主题电影》 中文名:荒野大镖客外文名:A Fistful Of Dollars出品时间:1964年制片地区:美国导演:塞尔乔·莱翁、蒙特·赫尔曼编剧:菊岛隆三 黑泽明类型:西部 分享9赞 洞潜吧 Kracai 与洞潜(潜水)有关的电影在的人顶下呗 分享13赞 小栗旬吧 阿若...