CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation）是一种新型DNA-蛋白互作研究技术，主要用于研究转录因子或组蛋白修饰在全基~因组上的结合位点。CUT&Tag的核心原理是利用抗体识别目标蛋白或特定的染色质修饰标记，并通过蛋白酶Tn5转座酶（Tagmentase）在目标位点上进行高效的DNA片段化和文库构建。Stephen Henikoff团队...
CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation）是一种专注于DNA-蛋白互作研究的革新性工具，主要用于识别转录因子或组蛋白修饰在全基~因组范围内的结合位点。CUT&Tag分析利用酶切与转座酶标记技术，精准定位转录因子或组蛋白修饰在基~因组中的结合位点，助力研究DNA-蛋白互作机制，为基~因组和表观遗传学研究提...
在研究中，CUT&Tag结果通常会与RNA-seq结合，分析目标蛋白结合位点附近的基因表达水平，尤其是启动子或增强子区域的靶基因，探究其对基因表达的调控作用。当目标蛋白为转录因子时，联合motif分析和共表达分析，研究可以进一步丰富转录因子-靶基因调控网络。同时，研究中会通过选择CUT&Tag和RNA-seq结果中的一些代表性位点...
转录因子,是能与DNA结合并影响基因转录速率的蛋白质;染色质修饰,如组蛋白甲基化或乙酰化,可以改变染色质状态,进而影响基因的可接近性和活性。CUT&Tag技术已被广泛应用于不同物种中,用来绘制组蛋白修饰和转录因子的图谱,帮助理解它们与各种生理和病理过程之间的关联,促进解析目标蛋白在疾病发展、细胞功能及生命过程的调...
使用CUT&Tag,可以大大降低细胞投入量以及操作时间,一天内就可以得到高质量的高通量测序文库。 CUT&Tag是蛋白-DNA互作的一大革新技术,它不需要使用甲醛交联以及免疫共沉淀,而是通过针对靶蛋白(如转录因子、染色质重塑蛋白)的抗体和Protein A的介导,使得与Protein A融合的Tn5酶(Tagmentase)在切割DNA片段的同时在序列...
转录因子,是能与DNA结合并影响基因转录速率的蛋白质;染色质修饰,如组蛋白甲基化或乙酰化,可以改变染色质状态,进而影响基因的可接近性和活性。CUT&Tag技术已被广泛应用于不同物种中,用来绘制组蛋白修饰和转录因子的图谱,帮助理解它们与各种生理和病理过程之间的关联,促进解析目标蛋白在疾病发展、细胞功能及生命过程的调...
1、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751对HCT 116细胞进行CUT&Tag实验。 2、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751对低细胞数量的NCCIT细胞进行CUT&Tag实验。 二、转录因子和辅因子分析 1、使用Nanog (D2A3) XP Rabbit mAb (Mouse Specific) #8822对F9细...
CUT&Tag技术介绍与应用 CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是一种新型DNA-蛋白互作研究技术,主要用于研究转录因子或组蛋白修饰在全基~因组上的结合位点。CUT&Tag的核心原理是利用抗体识别目标蛋白或特定的染色质修饰标记,并通过蛋白酶Tn5转座酶(Tagmentase)在目标位点上进行高效的DNA片段化和文库构建。
转录因子CUT&Tag,不得不说的“伤痛” 转录因子是一类特殊的蛋白质,通过与DNA特定序列结合,调控基因转录过程。CUT&Tag可以在活细胞中检测全基因组范围内转录因子的结合位点,是研究转录因子调控机制的利器。 但“高速运转”的细胞动态发生着转录翻译的生命活动,由于转录因子与基因组的结合具有动态或间接的特点,并非一直牢...
单细胞 CUT&Tag 分析 随着10X、BD等平台技术的推进，单细胞层面解析表达和开放染色质水平的研究方法已经得到很好的建立，并且在动植物种中都得到了很好的尝试。对于研究特定组蛋白修饰或转录因子结合的染色质区域的单细胞分析在技术上具有挑战性。今天小编和大家分享一篇今年四月份发表于Nature Biotechnology 的article 《...