Guardant Reveal是第一个利用ctDNA突变和ctDNA甲基化的MRD分析,通过他们的研究发现,首次界标采血时间(中位31.5天)的ctDNA突变MRD灵敏度仅有40.7%,ctDNA甲基化MRD敏度仅有48.2%,而两者结合的MRD灵敏度能提高到55.6%,这无疑是为MDR监测提供了新的思路¹⁰ 。 预测疗效和预后 ctDNA的半衰期较短,这使其与肿瘤...
此外,血浆中的ctDNA浓度极低,制备WGBS文库需要约2000ng基因组DNA,显著超过临床可用血浆样品中的ctDNA水平。 本文的改进版ctDNA-WGBS,可从微量ctDNA中准确绘制全基因组甲基化图谱,从200μL血浆中提取微量ctDNA,为防止样本丢失和低ctDNA要求,将末端修复、dA加尾、接头连接和亚硫酸盐转化过程在一个管中进行。另外使用...
以提取的外周血ctDNA作为检测目标样品,将提取的血浆cfDNA或是打断后的组织DNA进行亚硫酸氢盐转化;对转化后的DNA进行建库,得到测序预文库,通过测序,得到测序结果;对测序结果, 进行常规的生物信息学分析处理,进而得到甲基化数据。 5检测前的准备 5.1仪器 EDTAK2抗凝真空采血管(BD,Cat#367525) ...
本发明涉及生物技术领域,具体公开了一种高通量,高灵敏度检测肿瘤ctDNA甲基化的方法,探针库及试剂盒.所述方法通过对待测血样DNA引入2个公共的测序接头序列,利用甲基化不敏感的内切酶酶切,留下甲基化的DNA分子和没有酶切位点的非目标区域,之后进行PCR扩增以及探针杂交富集目标区域DNA,通过高通量测序分析鉴定出待测血样...
利用带有Index序列的引物对ctDNA进行多重PCR扩增建立文库等手段,检测ctDNA 5个抑癌基因中CpG位点的甲基化信息,最终筛选得到可用于胰腺癌检测的相关基因及其ctDNA甲基化的引物组合物,从而建立了NGS定量检测胰腺癌ctDNA抑癌基因甲基化的方法,所述方法使用的引物组合物筛选抑癌基因异常高甲基化位点,高于正常值则判断为...
一种用于肺癌早期筛查的组合物及试剂盒、以及肺癌早期ctDNA甲基化的检测方法专利信息由爱企查专利频道提供,一种用于肺癌早期筛查的组合物及试剂盒、以及肺癌早期ctDNA甲基化的检测方法说明:本发明公开一种用于肺癌早期筛查的组合物及试剂盒、以及肺癌早期ctDNA甲基化的检
目前cfDNA甲基化的检测方法已有相关文献发表,包括基于抗体的MeDIP技术(cfMeDIP),也可选择微量全基因组甲基化检测技术等。如果针对特定基因集或其他特定区域进行甲基化检测,可以采用数字PCR的方法。另外,每个实验室也会有自己的方法,目前尼奥基因组学研究院也在开发更有效的方法,已具备一定雏形,如果感兴趣也欢迎与尼奥...
因此,我国迫切需要开发一种适用于广泛人群的有效、经济、实用的HCC早期手段。基于此,本研究开发和验证了一种无创经济的血液ctDNA甲基化检测方法,实现高危人群的早期预警。 一、研究方法 图1. 研究设计 研究人员通过MONOD®技术对组织样本进行全基因组简化甲基化测序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing,RRBS),初...
1.技术领域:本发明涉及胰腺癌筛查检测技术领域,具体涉及一种ngs定量检测胰腺癌ctdna抑癌基因甲基化的方法。 2.技术背景:胰腺癌是一种恶性程度极高的消化系统恶性肿瘤, 2015年国内癌症统计数据显示,每年新发胰腺癌超9万例,居恶性肿瘤第9位,每年因胰腺癌死亡近8万例,居所有恶性肿瘤第6位。目前胰腺癌的总体5年生存...
1.本发明涉及生物检测技术领域,具体涉及一种用于肺癌早期筛查的组合物及试剂盒、以及肺癌早期ctdna甲基化的检测方法。 背景技术: 2.肺癌是一种善于隐匿的疾病,经常在疾病发展到晚期才表现出临床症状,70～80%的肺癌患者在诊断出患有肺癌症状时已是中、晚期,癌细胞已经扩散,错过了最佳治愈时机,五年生存率低。对于早期...