cat digitals.tsv | csvtk -t -H filter -f "1-3>0" --any 10.filter2类似于awk的数据过滤方式。 支持awk中的数值/表达式,按指定多列的数值进行过滤。 ## id列大于3cat names.csv|csvtk filter2-f'$id > 3'## id列大于3或 username列 为"ken"cat names.csv|csvtk filter2-f' $id > 3 ||...
csvtk -t join -f OTUID otutab.txt taxonomy.txt otus_fa.txt |head join+summary分组统计 # -g 参数指定分组 cat otutax.txt | csvtk -t summary -i -f OE2:mean,WT2:mean -g Phylum # 指定多个分组 cat otutax.txt | csvtk -t summary -i -f OE2:mean,WT2:mean -g Phylum,Class transpose...
csvtk xlsx2csv -i 2 -t test.xlsx #提取第2个sheet,输出格式为tab分隔符 csvtk xlsx2csv -i 2 test.xlsx #提取第2个sheet,输出格式为csv格式 csvtk nrow csvtk nrow test.csv # 查看csv文件的行数 csvtk nrow -t test.txt # 查看tab分割符的文件的行数 -csvtk ncol (用法和nrow一样) csvtk xlsx2...
选择:从CSV/TSV数据中选择特定字段/列。 csvtkcut-t -f column1,column2 input.tsv 排序:按特定字段/列对CSV/TSV数据进行排序。 csvtksort-t -k column1:nrinput.tsv 查看规格:查看当前表格的行列数。 csvtk -t stat input.tsv 尤其第一个美化查看可以说是非常实用,不过大文件需管道后接less,效果如下 用完...
csvtk -t cut -F -f "OTUID,OE1,WT1" otutab.txt | csvtk -t headers 1. 2. 3. 4. csv2md 表格转化为markdown格式 在用markdown写笔记,或做网页时,经常需要把表格排版为markdown格式,手动排版非常耗时。使用此工具会极方便 cut -f 1-7 metadata.tsv | csvtk -t csv2md 1. SampleID|Group|...
transpose类似于 R 中的t()对数据进行转置 csv2json则可以让数据转换为 json 格式 csv2md则是炫酷的直接变成 markdown 支持的表格+ 集合操作类 这一类命令是操作的重点,有很多子命令,其中部分类似于 unix 中对应的命令但又有所区别。 head查看文件开始若干行 ...
全省共破获毒品犯罪案件2708起,移诉毒品犯罪嫌疑人5503名,缴获各类毒品折合冰毒389.92公斤,查获吸毒人员11982人次,强戒3231人。济南锚定青少年毒品预防教育,重拳整治青少年易沾染的“上头电子烟”等违法犯罪,实现了18岁以下青少年吸毒“零发生”。 近年来,由于电子烟油方便运输和吸食,已成为合成大麻素的主要载体,吸贩毒...
全省共破获毒品犯罪案件2708起,移诉毒品犯罪嫌疑人5503名,缴获各类毒品折合冰毒389.92公斤,查获吸毒人员11982人次,强戒3231人。济南锚定青少年毒品预防教育,重拳整治青少年易沾染的“上头电子烟”等违法犯罪,实现了18岁以下青少年吸毒“零发生”。 近年来,由于电子烟油方便运输和吸食,已成为合成大麻素的主要载体,吸贩毒...
csvtk 可用于数据的处理,同时可以做一些常用的图。 安装方式 从https://github.com/shenwei356/csvtk/releases csvtk功能介绍 官方网址 下载最新版本的对应操作系统的软件二进制源码 tar -zxvf csvtk_linux_amd64.tar.gz sudo cp csvtk /usr/local/bin ...
csvtk默认输入数据为CSV格式,如为TSV请开启全局参数-t 输入数据列名最好唯一无重复 如果TSV中存在双引号"",请开启全局参数-l csvtk默认以#开始的为注释行,若标题行含#,请给全局参数-C指定另一个不常见的字符(如$) 实战 本次使用的数据是扩增子的otu表格和注释表格,还有分组文件。