其官方安装地址为:https://github.com/dcouvin/CRISPRCasFinder。 安装步骤 CRISPRCasFinder 的安装相对简单,推荐使用 Conda 环境进行配置。安装命令如下: conda env create-f ccf.environment.yml-n crisprcasfinder conda activate crisprcasfinder mamba init mamba activate mamba install-c bioconda macsyfinder=2.1...
物竞天择：CRISPRCasFinder软件安装指北（无需超级用户权限）
2、 进入文件夹 $ cd CRISPRCasFinder-master/ 3、安装软件 $ bash installer_CENTOS.sh exit 4、安装缺少的依赖软件 4.1. Perl模块 (1)手动安装 安装完成之后可能会出现 Installation done. You may need to reinstall some Perl's modules (with command: sudo cpanm ...) 说明自动安装在Perl模块出现了问题...
(vmatch2 mkvtree2 vsubseqselect2 fuzznuc needle)的相对路径改为据对路径,如vmatch2改为/home/yjk/biosoft/CRISPRCasFinder/bin/vmatch2 记得如果在CRISPRCasFinder/bin文件夹下没有找到fuzznuc needle就去/usr/lib/emboss下找,把它复制到CRISPRCasFinder/bin;isProgInstalled()的值改为"True"。 安装macsyfinder...
https://github.com/dcouvin/CRISPRCasFindergithub.com/dcouvin/CRISPRCasFinder 看看README,对于CentOS, 他们提出要先安装conda,这里默认大家用过,不会请自行搜索安装。 创建一个python2环境(>=2.7 & <3.0)并进入(重要!有一个软件python3不支持) ...
一、下载、安装CRISPRCasFinder wget-c https://github.com/dcouvin/CRISPRCasFinder/archive/master.zip bash installer_UBUNTU.sh source~/.profile 二、安装Date::Calc模块 https://metacpan.org/pod/Date::Calc perl CRISPRCasFinder.pl -h # Can't locate Date/Calc.pm ...