1. CRISPR-gRNA文库筛选技术结合表观遗传分析筛选神经元存活和轴突再生的负调控TF 作者利用RIKEN和TFCat数据库汇总了1893个小鼠基因组中的TF,并针对每个TF基因不同区域,从CRISPR-Cas9敲除(GeCKO)文库中选择了五条sgRNAs,然后pool在一起克隆至AAV2载体,建立了一个包含1893个AAV2-sgRNA的文库(维真生物助力提供)。随后...
本研究通过CRISPR文库,对30个基因进行筛选,以确定AML分化阻断的关键基因。并对关键基因进行验证为白血病...
基于CRISPR-gRNA文库筛选技术,研究人员对1893个转录因子(TF)进行全基因组筛选,寻找ONC后RGC存活和轴突再生的抑制因子,同时通过ATAC-seq和RNA-seq等分析损伤RGC的表观遗传和转录情况,确定了损伤响应性TF及其靶标。研究结果揭示了从轴突损伤转化为神经退行性疾病的核心转录程序,并提出了治疗神经退行性疾病的新策略。...
为了确定成年个体中枢神经系统轴突损伤导致神经退行性变的机制,研究人员利用了视神经挤压(ONC)模型,即通过切断视网膜神经节细胞(RGC)轴突导致ONC,进而导致大量RGC死亡和再生失败。 基于CRISPR-gRNA文库筛选技术,研究人员对1893个转录因子(TF)进行全基因组筛选,寻找ONC后RGC存活和轴突再生的抑制因子,同时通过ATAC-seq和RNA...
基因表达的变化是神经损伤的重要表现,在体内高通量筛选转录因子,以确定神经元损伤或轴突再生的关键调控因子是研究神经退行性疾病的有效方案,CRISPR-gRNA文库筛选结合多组学分析为实现体内大规模遗传筛选提供了双重保障。 文章标题:Core transcription programs controlling injury-induced neurodegeneration of retinal ganglion ...
| CRISPR-gRNA文库服务流程和优势 CRlSPR/Cas9是细菌和古生物菌用来抵抗外来入侵的一种获得性免疫系统。利用CRlSPR/Cas9技术建立的全基因组突变(基因敲除)库或者与某类功能相关的基因突变体(基因敲除)库,通过功能性筛选和富集以及随后的PCR扩增和深度测序(NGS)分析,筛选出与感兴趣的表型相关的基因的过程,被称为CRlS...
基于CRISPR-gRNA文库筛选技术,研究人员对1893个转录因子(TF)进行全基因组筛选,寻找ONC后RGC存活和轴突再生的抑制因子,同时通过ATAC-seq和RNA-seq等分析损伤RGC的表观遗传和转录情况,确定了损伤响应性TF及其靶标。研究结果揭示了从轴突损伤转...
CRISPR/Cas9技术原理 (Doetschman T et al., Circ Res. 2017)CRlSPR/Cas9gRNA文库筛选是利用CRlSPR/Cas9技术建立的动物全基因组或某类相关基因的gRNA文库,通过慢病毒侵染方式导入目的细胞,对细胞进行编辑,然后功能性筛选和富集细胞,通过NGS测序和生信分析的手段,筛选出具有特定功能的基因。gRNA文库筛选技术具有...
基于CRISPR-gRNA文库筛选技术,研究人员对1893个转录因子(TF)进行全基因组筛选,寻找ONC后RGC存活和轴突再生的抑制因子,同时通过ATAC-seq和RNA-seq等分析损伤RGC的表观遗传和转录情况,确定了损伤响应性TF及其靶标。研究结果揭示了从轴突损伤转化为神经退行性疾病的核心转录程序,并提出了治疗神经退行性疾病的新策略。
CRISPR是古细菌及细菌抵抗病毒的机制,当病毒攻击细菌时,细菌将该病毒的部分DNA整合到自身基因内组成CRISPR,当下次该病毒再次来袭之时,CRISPR转录的crRNA可通过碱基互补识别外源性DNA并激活Cas核酸内切酶的DNA切割活性,由此杀伤病毒。 1.2 CAS即为CRISPR相关的核酸内切酶,有多个亚型 1.3 CRISPR/Cas系统 image.png ### 2...