CRISPR-GPT由四个核心模块组成:LLM规划器、工具提供者、任务执行器和LLM代理。任务执行器作为状态机运行,负责子目标分解和进度控制。📊 CRISPR-GPT的评估结果 📊 通过12位CRISPR和基因编辑研究领域的专家对CRISPR-GPT代理的响应进行评估,结果显示其在准确性、推理、完整性和简洁性方面均优于通用的LLM代理。🏞️...
CRISPR-GPT智能体:CRISPR-GPT建立在大语言模型(LLM)驱动的设计和规划引擎之上,能够完成4个核心元任务(CRISPR基因敲除、表观编辑、先导编辑、碱基编辑)以及其他辅助功能(自由问答,脱靶预测),CRISPR-GPT集成了一组有用的技能和工具包,大语...
CRISPR-GPT智能体:CRISPR-GPT建立在大语言模型(LLM)驱动的设计和规划引擎之上,能够完成4个核心元任务(CRISPR基因敲除、表观编辑、先导编辑、碱基编辑)以及其他辅助功能(自由问答,脱靶预测),CRISPR-GPT集成了一组有用的技能和工具包,大语言模型智能体(LLM Agent)在需要时可以调用这些技能和工具包,以帮助人类用户完成不...
CRISPR-GPT 的独特之处在于它能够将特定领域的知识与 LLM 的计算效率相结合,以前所未有的方式简化实验设计流程,这是通用 LLM 无法实现的。 CRISPR-GPT 采用了一种将 CRISPR 技术与基于 LLM(特别是 GPT-4)的计算模型相结合的方法。该系统利用了一个包含 CRISPR 系统效率和引导 RNA (gRNA) 序列的综合数据集,这...
- CRISPR-GPT是一个LLM代理,用于自动设计基因编辑实验。 - CRISPR-GPT利用LLM的推理能力来选择CRISPR系统、设计引导RNA、推荐细胞递送方法、起草协议,并设计验证实验以确认编辑结果。 - CRISPR-GPT可以帮助非专业研究人员从零开始进行基因编辑实验,并在真实案例中验证了其有效性。 - 该研究探讨了自动基因编辑设计所涉...
CRISPR-GPT利用LLM的推理能力来促进以下过程:选择CRISPR系统、设计向导RNA、推荐细胞递送方法、起草方案和设计验证实验以确认编辑结果。CRISPR-GPT包含3种模式:“元模式”为用户(尤其是基因编辑领域的新人)提供了专门定义的通用基因编辑场景的管道(称为元任务)。“自动模式”根据用户输入自动生成必要的设计任务列表,方便...
CRISPR-GPT能够简化CRISPR基因编辑实验设计的复杂过程,帮助科研人员更便捷地进行基因编辑实验,未来更是有望与自动化实验室平台和机器人结合,实现端到端的自动化基因编辑实验,加速科学发现进程。 图片来源:bioRxiv 论文链接: 参考文献 1. EA, Aleman TS, Jayasundera KT, Ashimatey BS, Kim K, Rashid A, Jas...
就像基于大语言模型的ChatGPT生成一篇新文章一样,大语言模型也能生成全新的蛋白质。而现在,Profluent 公司展示了一种完全由人工智能从头设计的基因编辑器,并进行了首次成功的人类基因组精确编辑。 值得一提的是,OpenCRISPR-1是开源的,不...
Profluent公司也是一家初创公司，利用与ChatGPT这类工具同样的AI技术LLM（大语言模型），设计出完全新型的不存在于自然界的CRISPR蛋白质。LLM通过大量的蛋白质数据组训练，学习天然蛋白质的模式和结构。Profluent公司利用这些AI模型，生成具有特定特征的可优化基因编辑的蛋白质，比如可提高精确度和稳定性的，或更小的...
2024年4月29日,Nature发表文章‘ChatGPTfor CRISPR’ creates new gene-editing tools,介绍了人工智能助力创建基因编辑新工具。 为了发现之前未知的CRISPR基因编辑系统,研究人员对温泉、泥炭沼泽、粪便甚至酸奶中的微生物进行不断的探索。现在,得益于生成人工智能的进步,他们也许只需按一下按钮,就能设计出这些系统。