老师们好，我在用cp2k跑NPT的aimd的时候发现z轴方向变得异常的大，体系在扩成超胞前用PBEsol优化过...
1. 考虑你硬件的问题，再跑一遍看能不能复现错误。2. 3. 结构AIMD前优化了吗？SCF都收敛了吗？估计...
第一性原理分子动力学模拟(200多页):第一性原理动力学(FPMD)也称从头算动力学(AIMD),这种模拟是CP2K最大长处之一,速度远远胜于其它程序,而且非常成熟、完善,因此本培训花很大一部分时间对其做深入全面的讲解。本部分包含以下内容 • CP2K中做分子动力学的基础知识:完整讲解控制CP2K中动力学的&MD字段的各种选项...
第四天上午 7.电子结构分析 7.1. CP2K计算电荷密度 7.2. 自旋密度 7.3. HOMO/LUMO分子轨道 7.4. 电荷密度差分 7.5. 平面平均的电荷密度 7.6. Bader 电荷 案例分析:QM/MM模拟KCl表面 第四天 下午 8.复现文献案例以及如何进行分析 8.1. 文献案例分析: 2d -硼片作为锂离子电池负极材料的可能应用:DFT和AIMD研究...
从头算分子动力学模拟原理(AIMD) cp2k在ubuntu系统的安装 第一天 上午 1.CP2K基础知识 1.1. Inp文件结构格式 1.2. Inp文件基本语法结合实例,讲解inp文件常用命令 1.3. 基组和赝势 1.4. CP2K重要关键词详解 第一天 下午 2.CP2K程序实际计算过程 2.1. CP2K 基组赝势的选择和设定 ...
CP2K是一款较为强大的AIMD计算程序,免费开源,可高效并行。由于CP2K在做DFT时可以速度非常快地计算成千上万个原子的体系,因此在大规模模拟体系中经常被一些学者用到。比如计算原子数达到一千原子,计算时间可达到纳秒级别,这是非常诱人的!!从CP2K官网可以看到,一些学者已经用它在一些高大上的期刊上发表了研究成果。
若想让Multiwfn产生的CP2K输入文件里有实际的晶胞信息,载入到Multiwfn的文件里就必须有晶胞信息。用以下格式作为输入文件时,Multiwfn会既读取原子坐标也读取晶胞信息。 (1)cif文件 (2)含有CRYST1字段的pdb或pqr文件 (3)CP2K的输入文件(必须以.inp或.restart为后缀) (4)GROMACS的gro文件 (5)含有@<TRIPOS>CRYSIN...
专题一:“CP2K从头算分子动力学模拟技术与应用”预习视频内容基础理论知识高斯平面波混合方法(GAPW) 从头算分子动力学模拟原理(AIMD) cp2k在ubuntu系统的安装第一天 上午1.CP2K基础知识 1.1.Inp文件结构格式 1.…
从头算分子动力学模拟原理(AIMD) cp2k在ubuntu系统的安装 第一天上午 1.CP2K基础知识 1.1. Inp文件结构格式 1.2. Inp文件基本语法结合实例,讲解inp文件常用命令 1.3. 基组和赝势 1.4.CP2K重要关键词详解 第一天下午 2.CP2K程序实际计算过程 2.1. CP2K 基组赝势的选择和设定 ...