1. 下载安装VCFtools 在官网(https://vcftools.github.io/index.html)下载VCFtools安装包,下载地址链接为https://vcftools.github.io/downloads.html,该网页内界面如下所示,方框内为下载按钮。如果点击的是View On GitHub需要进入release中寻找最新版本(https://github.com/vcftools/vcftools/releases/tag/v0.1.16)。
conda install -y bcftools conda install -y vcftools snpEff conda install -y multiqc qualimap featureCounts 每装一个软件都可以使用--help来查看它是否安装成功,如果弹出帮助信息说明安装成功。
清华镜像安装 # conda install -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/ fastqc conda install bedtools conda install bowtie2 conda install bwa conda install fastqc conda install gatk4 conda install hisat2 conda install multiqc conda install trimmomatic conda install vcftools ...
安装软件使用mamba install <package_name>的语法来安装。如果你不知道某个软件包在mamba中的名字叫什么,可以直接搜索<“软件包名”+ conda + 安装>,这通常会将你带到conda/bioconda关于这个软件包的手册页面。比如搜索vcftools(一个用来操作vcf文件的工具),你可以找到如下页面,其中包含了关于如何使用conda来安装这一...
$ conda config --setauto_activate_basefalse#conda关闭自动激活base环境,也可使用true重新打开$ conda search augustus#conda搜索安装包$ conda install samtools,vcftools#使用conda一次安装多个软件包$ conda install --file=pkgs.txt#将需要安装的包名依次分行写入pkgs.txt然后一次安装$ conda list# 列出已安装的包...
3. 安装软件 conda install vcftools 是不是快了很多？？进一步的使用方法请参阅[1][2]。感谢上羽的...
conda create -n wes bcftools vcftools python=2 bwa source activate wes 1|55. 删除环境 conda env remove -n env_name 1|66.conda安装/卸载当前channels中不存在的包 anaconda search -t conda xxx #首先搜索包和对应的channel,注意这里是anaconda,而不是conda anaconda show rpetit3/aspera-connect #查...
conda create -n wes bcftools vcftools python=2 bwa source activate wes 5. 删除环境 conda env remove -n env_name 6.conda安装/卸载当前channels中不存在的包 anaconda search -t conda xxx #⾸先搜索包和对应的channel，注意这⾥是anaconda，⽽不是conda anaconda show rpetit3/aspera-connect #查看...
您的域名不仅会与您的网站长期保持关联，而且在品牌的成长故事中也将发挥至关重要的作用。 互联网上有...
Win或Linux系统下用conda安装Open Babel 一、Open Babel简介 Open Babel是一款开源自由软件,使用Open Babel可以将一种化学结构类型的文件格式转换成另一种文件格式,非常方便的进行各种类型的化学结构文件进行相互转换。 Open Babel由C/C++编写,并提供C ++,Perl,Python等的API接口方便开发。