输入conda安装命令: 在终端中输入以下命令来安装vcftools: bash conda install -c bioconda vcftools 这条命令会从bioconda这个conda频道中下载并安装vcftools及其所有依赖项。 执行安装命令: 按回车键执行上述命令。conda将开始下载并安装vcftools。这个过程可能需要一些时间,具体取决于你的网络连接速度和计算机的性能。...
在官网(https://vcftools.github.io/index.html)下载VCFtools安装包,下载地址链接为https://vcftools.github.io/downloads.html,该网页内界面如下所示,方框内为下载按钮。如果点击的是View On GitHub需要进入release中寻找最新版本(https:///vcftools/vcftools/releases/tag/v0.1.16)。 2. 安装TAR包 在下载vcftools...
如果你不知道某个软件包在mamba中的名字叫什么,可以直接搜索<“软件包名”+ conda + 安装>,这通常会将你带到conda/bioconda关于这个软件包的手册页面。比如搜索vcftools(一个用来操作vcf文件的工具),你可以找到如下页面,其中包含了关于如何使用conda来安装这一软件的信息。 但是考虑到使用R语言的需求更为普遍,接下来...
问conda环境中的依赖图vcfstatsEN# 列出所有虚拟环境 conda env list # 创建虚拟环境 conda create -...
$ conda config --setauto_activate_basefalse#conda关闭自动激活base环境,也可使用true重新打开$ conda search augustus#conda搜索安装包$ conda install samtools,vcftools#使用conda一次安装多个软件包$ conda install --file=pkgs.txt#将需要安装的包名依次分行写入pkgs.txt然后一次安装$ conda list# 列出已安装的包...
conda install -c conda-forge vcftoolsconda install -c conda-forge bwaconda install -c conda-forge picardconda install -c conda-forgegatk4gatk4conda install -c conda-forgegatk4gatk4conda install -c conda-forgegatk4gatk4conda install -c conda-forgegatk4gatk4conda install -c conda-forgegatk4...
conda install -n base conda-libmamba-solver 2. 设置libmamba作为默认solver conda config --set solver libmamba 3. 安装软件 conda install vcftools 是不是快了很多??进一步的使用方法请参阅[1][2]。 感谢上羽的提示 参考 ^https://github.com/conda-incubator/conda-libmamba-solver...
conda create -n wes bcftools vcftools python=2 bwa source activate wes 1|55. 删除环境 conda env remove -n env_name 1|66.conda安装/卸载当前channels中不存在的包 anaconda search -t conda xxx #首先搜索包和对应的channel,注意这里是anaconda,而不是conda anaconda show rpetit3/aspera-connect #查...
conda create -n wes bcftools vcftools python=2 bwa source activate wes 5. 删除环境 conda env remove -n env_name 6.conda安装/卸载当前channels中不存在的包 anaconda search -t conda xxx #⾸先搜索包和对应的channel，注意这⾥是anaconda，⽽不是conda anaconda show rpetit3/aspera-connect #查看...
(@INC contains: /export/home/s2978925/.pyenv/versions/miniconda-latest/envs/snippy/bin/../perl5 /export/home/s2978925/etc/tools/Trinity/HpcGridRunner-1.0.2/PerlLib /export/home/s2978925/etc/tools/SNP/vcftools/src/perl /export/home/s2978925/.pyenv/versions/miniconda-latest/lib/site_perl/...