perl 1_config_extract.pl 1_sra_11_14col config 发现得到的config文件,每行第一个字符都是"_",去掉: sed-i's/^_//' config 至此,得到样本的信息,用于数据格式转换和名称更改。 批量转换格式和名称的命令如下,在chip-seq文件夹下运行,config记得拷贝到此处: analysis_dir=raw cat config | while read i...
; export PERL5LIB; PERL_LOCAL_LIB_ROOT="/home/hakon/perl5${PERL_LOCAL_LIB_ROOT:+:${PERL_LOCAL_LIB_ROOT}}"; export PERL_LOCAL_LIB_ROOT; PERL_MB_OPT="--install_base \"/home/hakon/perl5\""; export PERL_MB_OPT; PERL_MM_OPT="INSTALL_BASE=/home/hakon/perl5"; export PERL_MM_...
InvalidArchiveError("Error with archive /vast/my_tools/miniconda3_2024/pkgs/perl-5.26.0-hae598fd_0.conda. You probably need to delete and re-download or re-create this file. Message was:\n\nfailed with error: [Errno 22] Invalid argument: '/vast/my_tools/miniconda3_2024/pkgs/perl-5.26...
active environment:base active env location:/home/rnaseq-analyzer/miniconda3 shell level:1 user config file:/home/rnaseq-analyzer/.condarc populated config files:/home/rnaseq-analyzer/.condarc conda version:23.7.3 conda-build version:not installed python version:3.11.4.final.0 virtual packages:_...
perlCopy codepip list | grep python 如果这两个版本不同,则可能需要在conda环境中使用该版本的Python来运行pip。 您可能需要在conda环境中安装该包。请尝试使用以下命令在conda环境中安装该包:Copy codeconda install packagename 如果该包不在conda的默认存储库中,则可以尝试添加其他存储库。 您可能需要激活conda...
因为你是直接用perl ../path调用它的。执行这个命令的shell会解析到perl程序的路径（很可能是conda的...
因为你是直接用perl ../path调用它的。执行这个命令的shell会解析到perl程序的路径（很可能是conda的...
conda config --addchannels conda-forge 官方的话这两个channel应该就够了的。 2019-6-12 update:最近在装raxml-ng的时候发现了一个新的channel叫genomedk,各位也可以添加到condarc里去 👇 conda config --addchannels genomedk 顺便安利一个我hoptop学长的教程:如何搭建一个本地的conda镜像(包含bioconda)供各位...
出于我的目的,我需要Google Colab中的osmNX 以前有人这么做过吗?我使用以下命令: !condaconfig --prepend channelsconda-forge 命令: !condainfo --envs 显示成功创建了环境。 当我运行该命令时: !condaactivate ox 将显示以下错误:CommandNotFoundError: Your shell has not been properl ...
ifconfig command not found 出现这个问题的原因是新版本的linux默认不带 ifconfig,官方推荐使用ip命令查看ip:ip addr ip addr查看如果获取不到ip 则首先查看网卡状态:systemctl status network 如果未启动:systemctl restart network 启动后再cd /etc/syyconfig/network-scripts目录下,确认网卡名,我的是enp4... ...