首要步骤是检查conda安装bioperl后的实际存储位置。在miniconda3目录下，我发现Bio::Seq模块确实已经成功安装。然而，问题出在bioperl模块并未被正确地添加到perl的@INC路径中。@INC是Perl查找模块的默认搜索路径，如果没有将新安装的模块添加到这里，即使模块存在，也无法被Perl系统找到。解决这个问题的关键...
我第一次遇到这种情况的时候,在网上查了很多的教程,试过各种方法,以及重新安装相应的模块还是不能解决,在各种折磨之后终于找到了原因。 查看conda安装bioperl后的存储的位置 conda list 查看miniconda3目录下,可以看到实际上我们已经安装上了Bio::Seq模块 bioperl模块的位置,不在 perl 的@INC里 把我们查到的模块路...
# conda直接安装/public/agis/changyuxiao_group/chenpeng/software/circos-0.69-9/circos-0.69-9/bin/circos -v|grep missing > missingfori in`cut -d" "-f2missing`;doconda install -c bioconda perl-$i;done# 仍然不能下载的在https://anaconda.org/bioconda/perl-list-util conda perl模块网站中找包#...
这种细节问题问我，我当然无法直接给出答案咯。毕竟，我的知识积累都不是靠死记硬背的。所以需要取回过头查看一下我的博客，才意识到，我竟然已经写了7篇教程，关于perl的模块。目录如下： ubuntu服务器解决方案第七讲-perl安装模块 Perl用cpan在linux上面安装模块 Perl及R及python模块碎碎念 pe ...
我第一次遇到这种情况的时候,在网上查了很多的教程,试过各种方法,以及重新安装相应的模块还是不能解决,在各种折磨之后终于找到了原因。 查看conda安装bioperl后的存储的...
我有时候会用到conda-pack来打包并迁移环境。前几天用conda下perl编译了下File::CountLines模块,这个模块也自动安装到了conda环境下。当时有点好奇,这个模块在conda-pack打包时是否会受到影响,今天测试下。 由于本人能力有限,描述可能有不当或者错误的地方,请仔细辨别后使用。
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大牛好,我用conda安装了perl之后,然后调用perl的时候报错说我缺少Bio::Sioq这个模块,请问接下来该如何用conda安装perl模块呢?还是只能用其他方式安装,那又该如何将这个模块和conda安装的perl联系起来呢?求解 conda perl bioperl Xzq2020-06-22 21:11:27 ...
之后，每次登录之后，系统会重新配置默认环境变量。除了 PATH，也可以修改 perl 模块目录，python 模块...
在准备完所有文件后，激活conda环境并运行pasa。初次运行时，可能会遇到报错。通常情况下，这类报错与软件中的Perl模块权限问题有关。解决方法是更改相关模块的权限，确保它们可执行。第二次报错可能与比对工具选择有关。若选择使用blat而非gmap，问题可能解决。但如果坚持使用gmap，需重新安装gmap并备份pasa-...