conda install -y -c hcc aspera-cli which ascp ## 一定要搞清楚你的软件被conda安装在哪 ls -lh ~/miniconda3/envs/download/etc/asperaweb_id_dsa.openssh 但是在Windows操作系统使用conda,大家安装了Anaconda这个exe格式的界面软件,根本就找不到它,而且也没办法进入可以交互输入命令的终端界面。 所以这里,...
conda install -y aspera-cli -c hcc ascp --help # 可以一次安装多个软件 conda install -y trim-galore hisat2 subread multiqc samtools salmon fastp ##作为新手,建议一个个软件安装,有时候软件之间会出现冲突,conda不能解决软件之间的冲突问题。 建议初学者安装软件,单个软件安装,如果批量安装软件,出现...
conda install-y-c hcc aspera-cli which ascp ## 一定要搞清楚你的软件被conda安装在哪 ls-lh~/miniconda3/envs/download/etc/asperaweb_id_dsa.openssh 但是在Windows操作系统使用conda,大家安装了Anaconda这个exe格式的界面软件,根本就找不到它,而且也没办法进入可以交互输入命令的终端界面。 所以这里,我们推荐...
conda create -n download conda activate download conda install -y -c hcc aspera-cli whichascp ## 一定要搞清楚你的软件被conda安装在哪 ls -lh ~/miniconda3/envs/download/etc/asperaweb_id_dsa.openssh 但是在Windows操作系统使用conda,大家安装了Anaconda这个exe格式的界面软件,根本就找不到它,而且也没...
conda install -c hcc aspera-cli=3.7.7 4. 安装好了以后,在这个环境下测试 prefetch -t ascp -a "/home/usr/anaconda3/envs/sradownload/bin/ascp|/home/usr/anaconda3/envs/sradownload/etc/asperaweb_id_dsa.openssh" SRR11111111 5. 完成!其实看别人的教程也有人直接用ascp就能下载的,不用搭配prefet...
conda install-y aspera-cli-c hcc##-c hcc,-c是指定它在hcc频道,就是指定安装的频道##调用帮助文档,不是软件的名字,如下ascp--help#有时候一个软件是一个工具集,它下面有很多工具,每个工具都有不同的名字,就调某个具体工具的名字,而不是调用软件的名字。#samtools,fastqc刚好有一个软件名和它的命令是一...
conda install -y -c hcc aspera-cli ascp --help # 可以一次安装多个软件 conda install -y python=3.7 libstdcxx-ng=9.1.0 trim-galore cutadapt=4 hisat2 subread multiqc samtools=1.16.1 salmon=1.4.0 fastp fastqc # mamba install -y python=3.7 libstdcxx-ng=9.1.0 trim-galore hisat2 subread ...
conda install -y aspera-cli -c hcc ascp --help # 可以一次安装多个软件 conda install ...
conda install -y -c hcc aspera-cli whichascp ## 一定要搞清楚你的软件被conda安装在哪 ls -lh ~/miniconda3/envs/download/etc/asperaweb_id_dsa.openssh 基本上每个软件都需要一个子环境,尤其是我们对该软件不熟悉而且怕它跟其它软件干扰的时候。比如使用conda安装pyscenic的一些依赖: ...
conda install tensorflow-gpu=1.12 cudatoolkit 这种方式下，每个虚拟环境需要单独安装它所对应的cuda以及...