在环境里安装了python之后（pip包一般会作为必要依赖自动被安装），你再pip install自然就会调用这个环境里...
conda install -c bioconda bioconductor-deseq2 创建和管理R环境Conda允许您创建多个环境,每个环境可以有不同的R版本和包依赖关系。这对于隔离不同项目的依赖关系非常有用。要创建一个新的R环境,请执行以下命令: conda create -n myenv r-base=3.6.0 这将创建一个名为myenv的新环境,并指定R的版本为3.6.0。...
Conda下载R踩坑 joe 1 人赞同了该文章 问题 Python的项目里需要接入一个R写的算法,这里需要下载R的编译器和rpy2。使用conda创建虚拟环境后,运行了以下指令尝试下载R: conda install R 结果显示 没能找到R,呜呜 解决 简单查找后无果,经同事下载不同的包需要不同的channels,并且R的channel好像是bioconda。去到bioco...
conda install r-stringi # R包 以 r- 开头 conda deactivate # 退出当前环境 安装指定版本 conda install numpy=1.11:即安装能模糊匹配到numpy版本为1.11 conda install numpy==1.11:即精确安装numpy为1.11的版本 006.安装R包 进入https://anaconda.org/ 搜索R包。例如repitools 拖动到最下面,有下载命令 conda ...
conda search r-4.4.1 # 安装 conda install r-base=4.4.1 # 安装完成后,设置路径和别名 which R # 输出结果:~/.conda/envs/R4.4/bin/R,这就是R被安装的路径 # 退出conda环境 conda deactivate # 运行R,查看现有镜像 R 哦,记得给这个conda安装的R添加到环境变量中,也可以起个别名(我给它命名为R4)...
conda activate renv # 安装(以R 4.1.3 版本为例,安装其他版本更换4.1.3即可) conda install -c conda-forge r-base=4.1.3普通安装方式如下:1.下载安装R# /home/wangwz/packages/R/R-4.3.1下载安装R4.3.1 wget http://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/src/base/R-4/R-4.3.1.tar.gz tar -zxvf R-4....
conda安装 pytorch lightning Conda安装R包,monocle对轨迹分支进行基因差异分析时占用内存非常大,且计算时间超长,仅对8000细胞进行分析就耗费4-5h,需要在服务器进行monocle轨迹。服务器是基于Linux系统的,对于非root用户或系统版本较低来说安装R是非常麻烦的,因此可以
Tools 中的 Install Packages… 进行 R 包的安装）。这里主要介绍如何用命令行来安装 R 包，如下所示...
devtools::install_github("bicciatolab/popsicleR") 在GitHub的包,都是使用 install_github 函数,不过少部分小伙伴可能会失败,因为他们访问GitHub会失败。 另外就是,大家在安装它的时候,它没办法很好的自动解决它自己的依赖问题,所以官网给了其系列依赖包的独立安装方式。
在Ubuntu上是不能直接通过sudo apt-getinstall r-base的方式安装最新版本的R,直接运行的结果是安装R-3.4版本。这是因为官方说这是比较稳定的版本,所以除非它的维护期结束,否则求稳 R 3.4 packages for Ubuntu on i386 and amd64 are available for all stable Desktop releases of Ubuntu prior to Bionic Beaver...