important; border-radius: 5px; box-shadow: rgba(0, 0, 0, 0.55) 0px 2px 10px;">`conda install -c conda-forge r-base 选择其中的一个命令进行运行即可` 运行结果如下: 图片 environment location后面就是R安装的位置,最后可以进入该路径调用R;且会安装一些常用的R包,可以根据自己的需求进行选择 ...
conda create -n new_environment 创建成功(new_environment),默认路径为/home/admin/miniconda3/envs 在用conda安装R时,指定路径到一个新的文件夹,也会创建一个新的环境,不知道安装别的软件(如fastqc)适不适用,我没试过(我觉的将新的环境放在默认路径更好统一管理)。 通过安装时指定路径创建的环境并没有名字。
conda create -n r_env r-essentials r-base 然而这个命令问题很大,首先solve environment需要solve非常久,这个问题至少2021年就存在了。其次截至本文时间(2023-5-10),R已经更新到4.3了,上面的命令还是只能安装到3.6,这可能是因为conda默认channel的r-essentials自22年6月至今都没有更新。 所以必须指定conda-forge: ...
conda create --name new_env_name --clone old_env_name 删除虚拟环境:conda remove -n conda_name --all 查看已有环境:conda env list 或conda info --envs 激活虚拟环境:conda activate conda_name 或 source activate conda_name 安装依赖包: conda env create -f environment.yml 更改镜像源: conda co...
`$ D:\Software\Anaconda3\Path\Scripts\conda-script.py create -n PRE` environment variables: CIO_TEST=<not set> CONDA_DEFAULT_ENV=base CONDA_EXE=D:\Software\Anaconda3\Path\condabin\..\Scripts\conda.exe CONDA_EXES="D:\Software\Anaconda3\Path\condabin\..\Scripts\conda.exe" CONDA_PREFIX=...
conda env export > environment.yml # 导出当前环境的配置到environment.yml文件 # 在新环境中: conda env create -f environment.yml # 根据environment.yml文件创建新环境 # 更新conda conda update conda # 更新所有已安装的包 conda update --all
$ conda env export > environment.yml # 别人在自己本地使用yml文件创建虚拟环境 $ conda env create -f environment.yml 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 12. 13. 14. 15. 16. 17. 18. 19. 20. 21. 22. 23. 24.
先前我们提到过conda 的使用,而现在,可以直接以R 代码的形式进行管理。 不过需要注意的是,这里的conda 命令,更多的还是为了方便的控制python。 常用命令如下: 代码语言:javascript 复制 conda_list()List all available conda environmentsconda_create()Create anewcondaenvironmentconda_install()Install apackagewithin ...
sudochown-R <USER> anaconda3 这时候再用conda create,就不会报错了,可以顺利创建环境。 When I useCondato create new environment, it displayed: ERRORconda.core.link:_execute_actions(337): Anerroroccurredwhileinstallingpackage'defaults::dbus-1.10.10-0'. ...
比如直接搜到了这个R 包的conda 安装方法:Bioconductor Rhdf5 :: Anaconda.org[3] 代码语言:javascript 复制 conda create-nR4.1.2-y r-base # 安装R环境 conda activateR4.1.2# 在激活的环境下安装 conda install-c bioconda bioconductor-rhdf5