首先,你需要打开你的命令行终端。这可以是你的系统自带的终端(如macOS的Terminal或Windows的Command Prompt/PowerShell),或者是你安装的Anaconda Prompt。 输入Conda安装命令: 在命令行终端中,输入以下命令来安装FastQC: bash conda install -c bioconda fastqc 这里,-c bioconda 指定了从Bioconda频道安装FastQC,因为F...
一、安装Mamba要使用Mamba,首先需要安装它。以下是安装Mamba的步骤: 打开终端或命令提示符窗口。 输入以下命令以安装Mamba: conda install -c conda-forge mamba 等待安装完成。二、安装FastQC一旦安装了Mamba,您可以使用它来快速安装FastQC。以下是安装FastQC的步骤: 打开终端或命令提示符窗口。 输入以下命令以使用Mamba...
conda remove -n py2 --all 安装软件 创建好独立的小环境之后就可以在小环境内安装软件,首先要查找下自己想安装的软件是否可以用conda安装 网站查询 https://anaconda.org/search https://bioconda.github.io/ 使用命令行搜索 conda search xxx 关键词搜索 #查询是否可以安装以及版本信息 conda search fastqc #安...
可以直接使用conda去安装一些我们需要用到的软件,比如我之后要搭建的blast Q1: 搜索哪些软件可以用conda下载 方法1:网站查询 https://bioconda.github.io/ 方法2:conda search XXX 注:有时候在服务器搜索会很慢 方法3:关键词搜索 Q2: 指定安装软件的版本(以fastqc为例) 在不指定版本的情况下,conda默认安装...
在base环境内,测试到了软件fastqc 在test环境内,未测试到软件fastqc 初步的测试结论 conda加入环境变量,不进入环境,依然可以安装和调用conda环境的软件,且实际安装和调用软件为base环境下软件。 但是,本次测试未对依赖较多的软件进行测试安装和实际使用,具体结论是否正确,有待进一步实践检验。
安装多个包 conda install fastqc multiqc 包更新 更新特定包 conda update fastqc 更新Python conda update python 更新conda本身及Anaconda元数据包 conda update conda conda update anaconda 防止包更新 conda update fastqc --no-pin 在环境的conda-meta目录中,添加一个名为pinned的文件,其中包含您不想更新的软件包...
输入以下的命令进行安装:conda install -y fastqc(软件名) 使用which softname或者find -name softname可以查看软件位置 安装指定版本的软件 conda install softname=1.01.0代指版本 先使用conda search softname参看当先版本。 使用conda建立环境 conda可以建立不同的环境,每种环境单独存在,互不干扰。
因为conda安装软件类似R需要从就近的镜像里安装包一样,因此软件安装成功后,必须配置镜像;但是不同于R安装包,这里软件安装一次,只需要设置一次镜像,此后不需要再次设置! 当然,R语言也可以通过写配置文件,达到一次设置,永久使用镜像的目的。 conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda...
11.1,然后看看fastp能不能用,命令,有东西出来就行: fastp -h 11.2,我们使用conda安装软件的时候,可以在这个网站查看conda安装的命令 https://anaconda.org/ 11.3,如查看fastqc这个软件的安装命令 11.4,进去,找到fastqc,再点进去,可以看见安装命令。大部分的软件都可以用conda下载的。