CLIP-seq结合了实验和测序方法,可以研究某种蛋白质在体内的RNA的结合情况。原理为基于RNA和RNA结合蛋白在紫外线照射下发生偶联,再经过蛋白特异性抗体将其沉淀,回收片段,再经添加接头,PCR扩增,进行高通量测序,最后经过生物信息学方法分析和处理得到相应的结果。本篇文章注重讨论后续的生物信息学处理。 这篇文章总结一下...
处理CLIP-seq数据的方法总结 CLIP-seq结合了实验和测序方法,可以研究某种蛋白质在体内的RNA的结合情况。原理为基于RNA和RNA结合蛋白在紫外线照射下发生偶联,再经过蛋白特异性抗体将其沉淀,回收片段,再经添加接头,PCR扩增,进行高通量测序,最后经过生物信息学方法分析和处理得到相应的结果。本篇文章注重讨论后续的生物信息...