随后,我们使用细胞模型对PCIF1和CTBP2进行了功能验证,结果表明,CTBP2可能作为PCIF1的关键辅助因子,在HNSCC中发挥关键的分子功能作用。 为了进一步研究PCIF1和CTBP2之间的潜在相互作用,我们使用交联和免疫共沉淀,然后进行高通量测序(CLIP-Seq)来评估这些蛋白结合的mRNA的相似性。通过分析CLIP-Seq数据集,我们观察到PCIF1...
RNA结合蛋白的种类 🌱 CLIP-seq的分类和应用场景 🔬 CLIP-seq的实验步骤及注意事项 📝 如何定制自己的CLIP-seq实验 🎯 在分享结束后,还会有答疑环节,实验中遇到问题的小伙伴可以提前准备好问题。希望大家通过这次分享,能够更加清晰地了解CLIP-seq实验的全流程,减少实验中的困惑和难题。 0 0 发表评论 发表 ...
技术简介 产品优势 实验流程 01实验步骤 02流程图 送样要求 案例解析 家人们,科研界的新宠儿来了! 国自然研究热点——RNA结合蛋白 现在有了更强大的研究工具 ieCLIP-seq(improved eCLIP-seq)技术! 能够更精确、更高效地识别和分析 RNA与蛋白之间的相互作用 立即体验ieCLIP-seq 开启您的科研新篇章! 【RNA结合蛋...
MAS-Seq 三代单细胞测序实验流程及生信分析 MAS-Seq-When-genes-are-not-enough MeatMaster· 2022-11-22 1789001:18 DAP-seq实验原理,DNA亲和纯化测序实验原理 钟小王· 2022-8-4 1223003:03 CHIP-seq VS CUT&RUN,实验原理介绍与区分,让你一次性搞懂染色质免疫沉淀与Cut &RUN 实验加油站· 2022-12-5 766...
2.Mapping the Transc riptome-Wide Landscape of RBP Binding Sites Using gPAR-CLIP-seq: Experimental Procedures.Methods Mol Biol. 2016;1361:77-90.
4 eCLIP-seq技术 2016年发表的eCLIP-seq技术是在CLIP-seq基础上的进一步改进，通过在免疫沉淀与逆转录步骤中添加Adaptor，显著提高了连接效率与实验准确性，减少了扩增倍率，保持了单核苷酸分辨率特性。eCLIP技术的改进流程简化了实验过程，提高了效率，为深入研究RNA与蛋白质之间的相互作用提供了强大工具。5 ...
CLIP-seq，全名Crosslinking immunoprecipitation-high-throughput-sequencing，是一种革命性的分子生物学技术，它通过紫外线交联和免疫沉淀相结合，揭示了蛋白与RNA之间互动的微观世界。其工作流程如精密的交响乐，首先通过UV交联将RNA和蛋白复合物紧密结合，形成不可逆的键结，随后细胞裂解、RNA片段化，目标蛋白...
CLIP-seq (crosslinking-immunprecipitationandhigh-throughput sequencing)即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序,可以高通量研究RNA结合蛋白在体内与众多RNA靶标的结合模式,并揭示其在一些重要生物学过程中的功能,是一项在全基因组水平揭示RNA分子与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。
HITS-CLIP(HIgh-Throughput Sequencing with CrossLinking-ImmunPrecipitation)又称为CLIP-seq,即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序,是一项蛋白与RNA相互作用的实验技术。其主要原理是基于RNA分子与RNA结合蛋白在紫外照射下发生交联,以RNA结合蛋白的特异性抗体将RNA-蛋白质复合体沉淀之后,回收其中的RNA片段,经添加接头、RT-PC...
本研究整合了多家实验室已公开发表的分析软件和脚本,对人前列腺癌DU145细胞系中的PUMILIO1(PUM1)蛋白CLIP-seq数据进行分析,总结出对于蛋白功能分析更有效的命令和参数,并建立了完整的生物信息学分析流程.运用该流程寻找PUM1蛋白在人前列腺癌发展中的潜在机制,本团队识别出PUM1在DU145细胞系中的1189个靶标,并发现PU...