RNA Immunoprecipitation Sequencing (RIP-seq) 技术简介 RNA immunoprecipitation sequencing (RIP-seq)是RNA免疫共沉淀结合高通量测序的一种技术,通过免疫沉淀靶蛋白来捕获互作的RNA。将捕获的RNA进行高通量测序,有助于了解转录后调控网络的动态过程。 技术优势 1. RNA-seq不仅局限于miRNA与RNA结合蛋白(RBP)的传统研究,...
CLIP-Seq,即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序(Cross-Linking and Immunoprecipitation High Throughput Sequencing),是一项在全基因组水平揭示RNA与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。 委托科研服务 近年来,该技术广泛应用于miRNA靶标鉴定等研究方向。在动物体内,成熟的单链miRNA与一系列蛋白形成miRNA诱导的沉默复合物(RISC)...
1. RIP-Seq is versatile in interpreting RNA-RBP interaction network with regard to various ncRNAs, such as miRNA and lncRNA. 2. Compared with CLIP-Seq, RIP-SEQ does not require conducting UV cross-linking, which makes it easy to operate and guarantee repeatable and accurate results. 3. Wit...
CLIP、RIP-seq两种技术,我觉得就可以简单理解为RNA版本的ChIP-seq encode 即主要研究特定RNA binding protein(RBP)在RNA上的分布以及RNA特定修饰的情况。从而达到以下目的-- (1)验证RNA与靶蛋白的直接相互作用及精确的结合位点; (2)在全基因组范围内鉴定RNA与RBP的相互作用网络; ...
蛋白质和RNA互作神器:RIP-seq & CLIP-seq | 环状RNA社区——CircRNA Community http://t.cn/A65igim7
Gene W. Yeo教授团队在2009年通过CLIP-seq技术成功在人胚胎干细胞中构建了细胞类型特异性剪接调节因子FOX2的RNA图谱。CLIP-seq技术通过高特异性结合特定的RNA分子与蛋白质复合物，揭示了RNA分子在细胞内的功能与调控机制。这项研究不仅为理解RNA剪接的复杂机制提供了新视角，也展示了CLIP-seq技术在解析RNA...
RIP-seq是RNA免疫共沉淀结合高通量测序的一种技术，通过免疫沉淀靶蛋白来捕获互作的RNA。将捕获的RNA进行...
在上一篇推文《国自然热点:RNA结合蛋白调控机制研究方法之RIP-seq》中,小编系统地为大家总结了RIP技术的发展和应用。RIP技术虽然已经成为研究RNA -蛋白相互作用中不可或缺的重要方法,它能够揭示在RNA生命周期中起关键作用的蛋白复合物以及它们在特定生物学过程中的作用。但是,我们也需要认识到RIP技术存在的一些重要的局...
CLIP-seq 的应用范围：（1）绘制全基因组范围的RNA 和RBP 相互作用图谱，解析“Argonaute （Ago ）—miRNA—mRNA ”三者的相互作用；（2）RBP 与miRNA 、lncRNA 等非编码RNA 的作用网络与功能的发现；（3）与 RIP-seq 相比，可以鉴定RBP 和RNA 之间的直接相互作用，确定 RBP 与miRNA 、lncRNA 等非编码 RNA ...