今天分享一篇8.7分的cis-pQTL联合单细胞分析SCI论文思路,这篇文章来源期刊详细信息如下: 文章的具体思路与步骤如下: 1、冰岛pQTL数据的下载、结局数据的下载 2、批量提取cis-pQTL数据 3、过滤提取好的cis-pQTL数据 4、批量cis-pQTL孟德尔随机化分析 5、批量共定位分析进一步筛选靶点 6、靶点基因的验证(使用额外的pQT...
1、冰岛pQTL数据的下载、结局数据的下载 2、批量提取cis-pQTL数据 3、过滤提取好的cis-pQTL数据 4、批量cis-pQTL孟德尔随机化分析 5、批量共定位分析进一步筛选靶点 6、靶点基因的验证(使用额外的pQTL或者eQTL) 7、对靶点基因进行单细胞分析 首先需要到网址:https://www.decode.com/summarydata/上下载冰岛pQTL的原...
为了研究已鉴定的cis-pQTL的普遍性,作者搜集了在前期发表的基于Somascan蛋白质组学平台报告的变异或处于高连锁不平衡(LD)(>0.8)的变异,并与已鉴定的cis-pQTL求交集得到569种蛋白质。在KARMA中观察到的603个显著的cis-pQTL中,有374个蛋白(Bonferroni-corrected(p<6.1×10−5))观察到复制证据,有229个cis-pQTL在...
Decode蛋白质pQTL数据处理完整代码—cis&trans(二) 上一期我们已经筛选完了P值小于5e-8,maf>0.01的SNP(也即pQTL), 现在我们需要把这些pQTL分成cis和trans。 Decode蛋白质pQTL数据处理完整代码(一) - 知乎 (zhihu.com) 本部分的代码内容现在已经移动到我的微信公众号啦,对知乎来的粉丝还是免费提供,公众号名字“生...
总的来说,作者认为这些cis-pQTL与乳腺癌风险共定位。 靶向药物分析 对于筛选得到的CD160、DNPH1、LAYN、LRRC37A2和TLR1五个蛋白,在多个数据库进行了系统搜索是否有任何一种以前曾被探索为药物靶标。结果显示,除了透明质酸靶向的LAYN外,没有一种蛋白质被注册为已知的药物靶标 ...