因此,通过药物筛选,发现洋地黄素和土霉素具有潜在的治疗作用。 6. circRNA-miRNA-mRNA调控网络构建 由DETMs预测的总共4674个基因,427条边。97个重叠基因被确定为进一步分析的指标。然后,我们整合了circRNA-miRNA网络和miRNA-mRNA调控网络,并使用Cytoscape构建了一个完整的circRNA-miRNA-mRNA调控网络网络(图7)。 7. RT...
（A）使用RPB的circRNA表达模式（每10亿个干净读段的连接读数）；（B）茶树在冷胁迫下鉴定出差异表达的circRNA；（C）在不同比较中鉴定出的上调和下调circRNA；（D）差异表达的circRNAs的功能注释；（E）冷胁迫下茶树circRNA-miRNA-mRNA相互作用网络；（F）突出显示了可能与网络中众所周知的冷相关miRNA相互作用的关键...
(A)使用RPB的circRNA表达模式(每10亿个干净读段的连接读数);(B)茶树在冷胁迫下鉴定出差异表达的circRNA;(C)在不同比较中鉴定出的上调和下调circRNA;(D)差异表达的circRNAs的功能注释;(E)冷胁迫下茶树circRNA-miRNA-mRNA相互作用网络;(F)突出显示了可能与网络中众所周知的冷相关miRNA相互作用的关键circRNA。 随后...
根据对应关系,建立了miRNA-mRNA网络(图6B)。这些预测的miRNA的表达数据在OncomiR数据库中获得。结果发现只有15个有显着差异表达(表2)。在上述miRNA的基础上,利用StarBase和LncBase获得了106个常见的lncRNA-miRNA调控对(图7A)。与GEPIA的表达...
在各种ncRNA中,AD患者大脑中微小RNA(miRNA)的失调已被充分证实,被认为通过调控其靶mRNA的翻译和/或稳定性,在AD的发病机制中发挥着重要作用。相对而言,通过复杂机制(与miRNA不同)调控基因表达的长链非编码RNA的病因学景观及其下游基因网络仍然不明...
目前仅有两个circRNA被明确阐明了功能：在拟南芥中，一个来自SEPALLATA3基因的circRNA通过R环的形成来调节mRNA的剪接，而这种circRNA的过表达将导致拟南芥中花器官的数量发生改变 (Conn et al. 2017)（下文将详细说明）；另一个例子是在水稻中，Os06circ02797在circRNA-miRNA-mRNA调控网络中结合OsMIR408，因而Os06...
镉毒性下的“分子网络” 我们通过构建一个复杂的circRNA-miRNA-mRNA网络,预测了镉毒性下主要的生物学功能和代谢途径。266个不同的circRNA、223个不同的miRNA和519个不同的mRNA在镉暴露下表达发生变化(图2)。这些变化的分子可能调控着细胞增殖、凋亡、氧化应激和炎症反应等关键细胞过程。
糖尿病及相关并发症中CircRNA-miRNA-mRNA的相互作用 MiRNAs被记录为通过控制信号级联中涉及的基因的上调或下调在糖尿病的发病机制中发挥重要作用。例如,miR375参与了胰腺细胞的发育。基于糖尿病及其相关并发症中miRNAs表达变化的特征,已经在电子数据库的帮助下从实验研究中浮现出来。
通过调节miRNA的表达起到miRNA海绵的作用.miRNA是一类由长度约22 个核苷酸组成的非编码单链RNA,它参与动,植物转录后基因表达的调控.circRNA-miRNA-mRNA网络是一些疾病的相关调节模式,circRNA可作为miRNA海绵发挥作用,并调节下游相关mRNA.本文中,我们讨论了目前对于circRNA的理解以及通过circRNA-miRNA-mRNA网络在疾病中的...