因此,通过药物筛选,发现洋地黄素和土霉素具有潜在的治疗作用。 6. circRNA-miRNA-mRNA调控网络构建 由DETMs预测的总共4674个基因,427条边。97个重叠基因被确定为进一步分析的指标。然后,我们整合了circRNA-miRNA网络和miRNA-mRNA调控网络,并使用Cytoscape构建了一个完整的circRNA-miRNA-mRNA调控网络网络(图7)。 7. RT...
（A）使用RPB的circRNA表达模式（每10亿个干净读段的连接读数）；（B）茶树在冷胁迫下鉴定出差异表达的circRNA；（C）在不同比较中鉴定出的上调和下调circRNA；（D）差异表达的circRNAs的功能注释；（E）冷胁迫下茶树circRNA-miRNA-mRNA相互作用网络；（F）突出显示了可能与网络中众所周知的冷相关miRNA相互作用的关键...
根据对应关系,建立了miRNA-mRNA网络(图6B)。这些预测的miRNA的表达数据在OncomiR数据库中获得。结果发现只有15个有显着差异表达(表2)。在上述miRNA的基础上,利用StarBase和LncBase获得了106个常见的lncRNA-miRNA调控对(图7A)。与GEPIA的表达...
mRNA翻译成肽链的过程受调节因子的调控,大多数miRNA可以调节特定的相应mRNA翻译成蛋白质。目前已有研究表明,由circRNA失衡引起的miRNA和mRNA的表达紊乱可驱动多种癌症的发生和转移。因此,以circRNA为核心的分子调控网络可能在肝细胞癌的发生中发挥重要作用。 circACVR2A来源于ACVR2A基因,总长度为473 bp。2013年,几项研究...
糖尿病及相关并发症中CircRNA-miRNA-mRNA的相互作用 MiRNAs被记录为通过控制信号级联中涉及的基因的上调或下调在糖尿病的发病机制中发挥重要作用。例如,miR375参与了胰腺细胞的发育。基于糖尿病及其相关并发症中miRNAs表达变化的特征,已经在电子数据库的帮助下从实验研究中浮现出来。
目前仅有两个circRNA被明确阐明了功能:在拟南芥中,一个来自SEPALLATA3基因的circRNA通过R环的形成来调节mRNA的剪接,而这种circRNA的过表达将导致拟南芥中花器官的数量发生改变 (Conn et al. 2017)(下文将详细说明);另一个例子是在水稻中,Os06circ02797在circRNA-miRNA-mRNA调控网络中结合OsMIR408,因而Os06circ02797...
在结直肠癌中研究人员也发现存在circRNA-miRNA-mRNA网络,circFMN2可通过miR-1182/hTERT轴促进结直肠癌细胞的增殖与迁移[20]。另外,circRNA-miRNA轴对肿瘤细胞增殖的影响在骨肉瘤、胰腺导管腺癌、神经胶质瘤、肝癌等多种恶性肿瘤中也被研究证实。 3.2 影响肿瘤细胞的迁移和侵袭 肿瘤的侵袭与转移是多因素相互作用的结果...
然而,过度激活免疫反应可能会对宿主造成严重的损伤。COVID-19患者中SARS-CoV-2可诱发免疫风暴,从而对组织和器官造成广泛损伤。而circRNA-miRNA-mRNA调控网络有助于调控免疫相关因子及其涉及的信号通路(NF-kB/MAPK/mTOR)降低免疫风暴,可能成为治疗COVID-19的新途径。
特别是在miRNA与circRNA之间的相互作用中,还需要更深入的了解其调控网络和对Wnt/β-连环蛋白信号通路的调节作用。此外,随着环状RNA研究的深入,越来越多的新的Wnt相关的circRNA可能会被发现,并且对于HCC的预后和治疗可能具有重要的意义。因此,未来的研究方向应该重点关注Wnt相关的circRNA在HCC中的作用机制,以及开发新的...
此外,有些circRNA可以与多个miRNA结合,影响多种基因的调控。 2. 调节转录:有些circRNA可与转录因子结合调控基因的转录,结合mRNA可以分析circRNA的作用位点。circRNA与RNA聚合酶Ⅱ相互作用并调节转录,或者ElcircRNA可与小核糖核蛋白互作用,再与RNA聚合酶Ⅱ结合。 3. 蛋白质易位:circRNA可以通过在细胞核和细胞质之间易位...