数据来自R软件“survival”包自带示例数据集“lung”,包含228行观测,介绍NCCTG晚期肺癌患者的生存率。以下是数据的简单展示,其中变量inst解释为机构代码;time解释为以天为单位的生存时间;status解释为删失状态1 = 删失,2 = 出现失效事件;age解释为年龄...
R语言潜类别分析 r语言cindex roc曲线和cindex曲线属于一致性的指标。后台有粉丝问怎么绘制cox回归中的时间相关性roc曲线和时间相关性cindex曲线,今天来演示一下。 我们先导入数据和R包 library(survival) library("survminer") library(foreign) bc <- read.spss("E:/r/test/Breast cancer survival agec.sav",...
医学和生信笔记,专注R语言在临床医学中的使用,R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。 R语言临床预测模型系列,从入门到进阶,目前已更新20+篇优秀推文,持续更新中,欢迎订阅。 今天学习C-index的比较。 二分类资料C-index的比较 二分类资料...
评价模型的好坏主要有两个⽅⾯,⼀是模型的拟合优度(Goodness of Fit),常见的评价指标主要有R⽅、-2logL、AIC、BIC等;另外⼀个是模型的预测精度,顾名思义就是模型的真实值与预测值之间差别⼤⼩,均⽅误差,相对误差等。在临床应⽤上更注重预测精度,建模的主要⽬的是⽤于预测,⽽C-index它就...
1、利用Hmisc包中的rcorr.cens函数, 局限: 只能处理一个预测变量 对超过2分类的分类变量处理粗糙 # 加载包及生成数据框,这里生成数据框主要是为了方便大家理解,因为大家通常都是将Excel的数据读进R,存储为数据框格式library(survival)library(Hmisc)age <- rnorm(...
~ age + bp,data = sample.data)r Somers' Rank Correlation for Censored Data Response variable:Surv(os, death)C Dxy aDxy SD Z P n age 0.453 -0.094 0.094 0.056 1.69 0.0902 200 bp 0.498 -0.003 0.003 0.054 0.06 0.9517 200 这个是概率论的...
【单选题】下面给出一个URL地址:http://www.tsinghua.edu.cn/docs/cindex.html,对它的描述错误的是()。 A. http表示使用超文本传输协议 B. www.tsinghua.edu.cn标识了要访问的主机名 C. www.tsinghua.edu.cn/docs标识了要访问的主机名 D. 整个地址定位了要访问的主机名...
原创国漫,日本漫画,港台漫画,韩国漫画,欧美漫画,好漫画,为看漫画的人而生。热门漫画:火影忍者、海贼王1144、死神、一拳超人、古惑仔88、山海逆战等
cindex.orig=1-rcorr.cens(fp,Surv(time,death)) [[1]]###计算出的C-index ### ### Method 2.compareCcode ### ### data <- read.csv('survivaldta.csv') ###读入csv格式数据### library(compareC) ###加载compareC包,前提是安装了,如果没有安装,请百度如果安装R package...