Train = train[, c("OS.time", "OS", variables)], Test = test[, c("OS.time", "OS", variables)] ) # 预测并计算 C-index rs <- lapply(val_dd_list2, function(x) { cbind(x[, 1:2],RS = predict(fit, newdata = x,type = "lp")) }) 可视化(timeROC) # C-index--绘制 l...
cindex指数定义 Cindex指数是一个衡量文本相似度的指标。它通过计算两个文本中共有的最长连续子序列的长度,来衡量它们的相似程度。Cindex指数的取值范围为0到1,其中0表示两个文本完全不相似,1表示两个文本完全相同。Cindex指数越接近1,表示两个文本越相似。
其中C为C-index的补数,C-index=1-C=1-0.264=0.736 或者C-index=abs(Dxy)/2+0.5=0.736 3.4 方法四,利用rms包中的内部验证函数validate()函数 validate(cox4,method = "boot",B=500,dxy=T,u=100) index.orig training test optimism index.corrected Dxy 0.4721 0.4907 0.4535 0.0372 0.4348 R2 0.3647 0.4...
bootstrap法内部验证计算c-index指数 Bootstrap法内部验证计算c-index指数是评估模型预测准确性的重要方法。 该方法能有效检验模型在内部数据中的性能表现 。Bootstrap法基于有放回抽样构建多个子样本。子样本用于多次训练模型以获得更稳定结果。C-index指数衡量预测结果与实际结果的一致性 。取值范围在0到1之间,值越高...
1. 未校准的时间C-index library(pec)#计算时间cindex#再建一个模型，对比model2model3<-cph(Surv(time,status==0)~age+lvi+g+rt, x=T,y=T,surv=T, data=aa)#pec包的cindex()可计算多个模型在多个时间点的C指数pk<- cindex(list("模型2"=model2, "模型3"=model3), formula=Surv(ti...
C-index，也称为一致性指数，是评估临床预测模型预测能力的重要指标。它计算的是模型预测结果与实际观察结果一致的对子在所有可能对子中的比例，范围从0.5（随机猜测）到1（完全一致）。C-index由Frank E Harrell Jr在1996年提出，特别适用于评估生存分析中的COX模型的区分度。在模型评价中，C-index更...
一、coxph( )的C-index survival包中coxph()函数的多因素Cox回归结果可直接汇报C-index及其标准误(se),根据这个结果:95CI%=C-index +/- 1.96*se. #coxph() model1<-coxph(Surv(time,status==0)~age+n+er+lvi+g+rt,d...
所谓C-index,英文名全称concordance index,中文里有人翻译成一致性指数,最早是由范德堡大学(Vanderbilt University)生物统计教教授Frank E Harrell Jr1996年提出,主要用于计算生存分析中的COX模型预测值与真实之间的区分度(discrimination);现阶段用的最多的是肿瘤患者预后模型的预测精度。一般评价模型的好坏主要有两个方面...
其实指数C-index和AUC是差不多的，针对二分类 lo_go_is_tic 回归的 C-in_dex 等价于 ROC 曲线下面积AUC。C-index，英文名全称concordance index，中文里有人翻译成一致性指数，最早是由范德堡大学（Vanderbilt University）生物统计教教授Frank E Harrell Jr 1996年提出，主要用于计算生存分析中的COX...
统计里面,评价指数C-index和AUC的区别 其实指数C-index和AUC是差不多的,针对二分类 lo_go_is_tic 回归的 C-in_dex 等价于 ROC 曲线下面积AUC。C-index,英文名全称concordance index,中文里有人翻译成一致性指数,最早是由范德堡大学(Vanderbilt University)生物统计教