chromosome conformation capture称之为染色质构象捕获,简写为3C, 是一种生物化学手段,可以通过实验手段来研究空间结构上相近的染色质,本文简单介绍下3C的实验过程和原理。 实验流程如下所示 可以分成以下4个步骤 crosslink chromatin, 染色质交联。通过甲醛固定细胞,可以在空间结构相邻的染色质片段之间产生共价氢键 digest...
chromosomeconformationcapture:染色质构象捕获技术在传统的3c技术中得到junctionreads后需要针对感兴趣的两个目标片段设计引物通过pcr反应将这两个区域构成的junctionreads扩增出来通过pcr产物的有无和定量可以评估目的片段之间相互作用关系的有无和强度 chromosomeconformationcapture:染色质构象捕获技术 chromosome conformation ...
在过去10年中,染色体构象捕获(chromosome conformation capture 3C)技术及其该技术的拓展技术(4C,5C,Hi-C,ChIA-PET),使人们能够以超强的分辨率和高通量测序分析细胞核内的三维立体结构 3C技术:走向三维(3D)基因组学的基础 Fig1 1.交联:用甲醛交联染色质,固定蛋白与DNA,使染色质保持三维结构。 2酶切:再用一种限...
Several of the 114 unique sequences from all autosomes were found to interact primarily with the maternally inherited H19 imprinting control region (Zhao Z et al 2006 Nature Genet 38:1341). 4C technology (chromosome conformation capture (3C)-on-chip) allows for an ......
chromosome conformation capture:染色质构象捕获技术 欢迎关注”生信修炼手册”! chromosome conformation capture称之为染色质构象捕获,简写为3C, 是一种生物化学手段,可以通过实验手段来研究空间结构上相近的染色质,本文简单介绍下3C的实验过程和原理。 实验流程如下所示...
核心的技术就是3C(Chromosome Conformation Capture)实验技术。 染色质构象首先被甲醛交联固定;随后,基因组被限制性内切酶消化;存在相互作用的染色质由于空间接近,在重新连接酶消化后的基因组时,存在相互作用的染色质将被连接到一起;解交联纯化DNA后,针对感兴趣的两个特定基因组区域分别设计引物,并对重连接产物进行PCR扩...
chromosome conformation capture称之为染色质构象捕获,简写为3C, 是一种生物化学手段,可以通过实验手段来研究空间结构上相近的染色质,本文简单介绍下3C的实验过程和原理。 实验流程如下所示 可以分成以下4个步骤 crosslink chromatin, 染色质交联。通过甲醛固定细胞,可以在空间结构相邻的染色质片段之间产生共价氢键 ...
Chromosome conformation capture (3C) assays are used to map chromatin interactions genome-wide. Chromatin interaction maps provide insights into the spatial organization of chromosomes and the mechanisms by which they fold. Hi-C and Micro-C are widely us
qpcrconformationchromosomecapturequantitativeundigested Visithttp://.epigenesys.euforotherepigeneticsandsystemsbiologyprotocols Page1of9 QuantitativeChromosomeConformation Capture(3C-qPCR) VuthyEa 1 ,ThierryForné 1 andFranckCourt 1,2 1 InstitutdeGénétiqueMoléculaire,UMR5535CNRSUniversityofMontpellier,France 2...
Chromosome conformation capture (3C) technology is a pioneering methodology that allows in vivo genomic organization to be explored at a scale encompassing a few tens to a few hundred kilobase-pairs. Understanding the folding of the genome at this scale is particularly important in mammals where di...