该研究综合ChIP-seq、DAP-seq、RNA-seq和EMSA等技术发现转录因子MeGI主要通过调节昼夜节律、水杨酸生物合成和类黄酮生物合成途径中的基因来调控油柿的性别控制功能。爱基百客为该研究提供ChIP-seq的技术支持。 研究背景 雌雄异株系统是维持遗传多样性的重要策略。转录因子 MeGI 通过促进君迁子(Diospyros lotus)和柿(D....
研究通过比较突变体花序分生组织RNA-seq数据,获得了受SEP3调控的基因。研究发现SEP3-AG靶标的seq-DAP-seq和ChIP-seq具有高度重叠,与AG和/或SEP3相比差异表达基因(DEGs)比例显著,表明能够通过seq-DAP-seq识别那些在体内被SEP3-AG复合物结合和调控的转录因子结合位点。研究还发现了仅在seq-DAP-seq中而不在ChIP-se...
1、相同点 在基因组水平上鉴定转录因子的结合位点,具有与ChIP-Seq同样的功能,都是通过体外蛋白表达技术,表达出带有标签的转录因子,和基因组DNA文库在体外进行结合,然后分离出与转录因子结合的DNA,再使用高通量测序,找到转录因子的结合位点。 2、差异点
ChIPseq和DAPseq报告解读, 视频播放量 153、弹幕量 0、点赞数 7、投硬币枚数 6、收藏人数 12、转发人数 3, 视频作者 vivxiang, 作者简介 ,相关视频:IGV软件查看IP实验结果
DAP-Seq(DNA亲和纯化测序) | 传统的ChIP-seq 是进行体内检测 TFBS 的主要方法,繁琐步骤和材料需求阻拦了很多科研进程。DNA亲和纯化测序方法,成功将体内结合实验转移到体外,解决了ChIP抗体制备的困扰,极大的提高 DNA Binding Site发现的效率。 DAP-seq不仅能够超高通量查找TFBS,还能深入了解众多TF的生物学特性和结合位...
蓝景科信DAP-seq完整技术服务实验流程和原理(DAP-seq和ChIP-seq的特点)1、DAP-seq在基因组水平上,鉴定转录因子的结合位点(transcriptionfactorbindingsites,TFBS)非常重要。ChIP-seq是进行体内检测TFBS的主要方法。然而,ChIP-seq依赖于抗体质量,这对低表达的蛋白质具有很大的挑战性。所以,ChIP-seq通常在规模上受到限制,...
DNA亲和纯化DAP-seq/ChIP测序应用于非模式生物水稻小麦玉米苜蓿大豆百脉根等,表观遗传学研究中,转录因子调控位点的发掘一直是一个难题,ChIP作为一个经典的技术存在很多弊端,最主要的抗体问题,对于非模式植物更难入手,DAP-seq作为Chip同样功能的体外实验,是研究非模式植物的顺反组的有利技术。br/本实验室先后在水稻,小...
表观遗传学研究中,转录因子调控位点的发掘一直是一个难题,ChIP作为一个经典的技术存在很多弊端,最主要的抗体问题,对于非模式植物更难入手,DAP-seq作为Chip同样功能的体外实验,是研究非模式植物的顺反组的有利技术。本实验室先后在水稻,小麦,玉米,苜蓿,大豆,百脉
MADS转录因子的同源蛋白SEPALLATA3 (SEP3)和AGAMOUS (AG)是调控拟南芥花发育分化的重要DNA结合蛋白。在雌蕊发育阶段,SEP3和AG形成异源四聚体,通过识别CArG-box序列来调控基因的表达。Seq-DAP-seq技术与ChIP-seq联合使用,可用于分析转录因子的DNA结合域与基因组的互作。