染色质免疫沉淀技术（Chromatin immunoprecipitation assay, ChIP）是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法，主要包括ChIP-qPCR和ChIP-seq两种；其中ChIP-qPCR用来验证与目标蛋白结合的已知DNA片段，ChIP-seq用来筛选与目标蛋白结合的未知DNA片段。染色质免疫沉淀ChIP实验原理 先用甲醛交联细胞
03、靶向目标区域的TF结合/组蛋白修饰干扰实验,检测其影响下游靶基因的表达 (1)目的基因结合/修饰干扰细胞系的构建:荧光素酶活性分析实验(Luciferase activity assay)、CRISPER-CAS9靶向目标区域引入突变/修饰: 确定并验证与转录因子结合的motif 验证与该motif结合之后是否能影响靶基因表达 不同区域引入突变以确定关键结合...
ATAC-seq: 转座酶可及性染色测序(assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing,是一种用于研究表观遗传调控的技术,于 2013 年在人类免疫细胞中建立。 其原理是利用转座酶 Tn5 …
(1)凝胶阻滞实验(定性) 凝胶阻滞或电泳迁移率实验(Electrophoretic mobility shift assay,EMSA),是一种研究DNA结合蛋白质和相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。 原理:基于DNA-蛋白质或RNA-蛋白质复合体在聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAG...
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing)是一种高通量测序技术,旨在研究基因组中开放染色质区域。该方法能够快速、灵敏地识别出基因组上哪些区域的染色质结构较为松散,从而使得DNA更容易被蛋白质因子如转录因子结合。 ChIP-seq(Chromatin Immunoprecipitation Sequencing)是一种高通量测序技术,...
是将染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)与二代测序相结合的表观遗传研究技术,能够高效地在全基因组范围内对DNA和蛋白的相互作用进行检测,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。 ChIP-seq Assay Kit for Histone Methylation(Laboratorytalk,2016) ...
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing)是2013年由斯坦福大学William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室开发的用于研究染色质可及性(通常也理解为染色质的开放性)的方法, 原理是通过转座酶Tn5容易结合在开放染色质的特性,然后对Tn5酶捕获到的DNA序列进行测序。
(1)目的基因结合/修饰干扰细胞系的构建:荧光素酶活性分析实验(Luciferase activity assay)、CRISPER-CAS9靶向目标区域引入突变/修饰: 确定并验证与转录因子结合的motif 验证与该motif结合之后是否能影响靶基因表达 不同区域引入突变以确定关键结合位点...
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing)是一种高通量测序技术,旨在研究基因组中开放染色质区域。该方法能够快速、灵敏地识别出基因组上哪些区域的染色质结构较为松散,从而使得DNA更容易被蛋白质因子如转录因子结合。 ChIP-seq(Chromatin Immunoprecipitation Sequencing)是一种高通量测序技术,...
ATAC-seq全称Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing,即利用转座酶研究染色质可进入性的高通量测序技术。 DNA转座,是一种把DNA序列从染色体的一个区域搬运到另外一个区域的现象,由DNA转座酶来实现。这种转座插入DNA,也是需要插入位点的染色质是开放的,否则就会被一大坨高级结构给卡住...