H3K27ac:代表 H3 组蛋白的第 27 位赖氨酸的乙酰化 组蛋白修饰应用于 Chip-seq 分析领域,有助于解析表观遗传特征和生物学功能。表观基因组学联盟提出的五个“核心组蛋白标记”在 Chip-seq 分析中得到了广泛应用: 与增强子区相关的 H3 赖氨酸 4 单甲基化(H3K4me1)或 H3 赖氨酸 27 乙酰化(H3K27ac) H3...
以剖析表观遗传特征和生物学功能；2、 ChIP-seq可用来研究转录因子结合位点，解析该转录因子作用的通路信息；3、ChIP-seq技术可得到核小体的定位图谱，核小体定位在转录调控，DNA复制和修复等多种细胞过程中并起着重要作用；4、ChIP-seq技术可研究DNA的甲基化情况，DNA甲基化会引起染色体结构、DNA构象、DNA稳定性以...
表观遗传学的研究核心还是在于不同层次转录调控的研究。应用第二代测序技术,科学家们针对不同层次的转录调控阶段开发了等一系列测序技术进行研究,硕果累累。比如,针对DNA结合蛋白在全基因组结合位点分布的探索,开发了ChIP-seq技术;针对染色质开放程度的衡量,开发了DNase-seq,ATAC-seq技术;针对基因组甲基化水平的探索,...
一般来说,表观遗传调控的作用模式在真核生物中是高度保守的。因此,表观遗传调控是各种生物过程的基本组成部分(Allis and Jenuwein, 2016)。对非生物胁迫响应的表观遗传调控的研究,揭示了由表观遗传元素协调的植物胁迫响应的部分或完整的图景(Kim et al., 2015;Asensi-Fabado et al., 2017;Luo et al., 2017...
别走开，正文马上就要开始啦！点这里看解析表观遗传学的工具——ChIP-seq（一）。05ChIP-seq实验的应用 5.1研究组蛋白的修饰情况 在前面的文章中我们简单提了提组蛋白的修饰，为了让大家能够更清楚、更直观地理解这个概念，小远还是决定给大家再介绍一些基础知识，这里先帮大家温故一下核小体的概念：核小体是染色...
1、ChIP-seq可以研究组蛋白的修饰情况,以剖析表观遗传特征和生物学功能; 2、 ChIP-seq可用来研究转录因子结合位点,解析该转录因子作用的通路信息; 3、ChIP-seq技术可得到核小体的定位图谱,核小体定位在转录调控,DNA复制和修复等多种细胞过程中并起着重要作用; ...
为了帮助大家理解,小远在解析表观遗传学的工具——ChIP-seq(一)中介绍了许多基础知识,有了基础知识做铺垫很多东西理解起来就会更加容易。当时由于篇幅的原因,有些知识点只是简单提了提,没有具体展开,而今天的内容主要是给大家介绍ChIP-seq应用的一些文献实例,如果在这个过程中涉及到一些比较重要的知识点,小远还是会...
Chip-seq和ATAC-seq分别用于研究蛋白质-DNA相互作用和开放染色质区域,然而,为了获得更全面和深入的生物学见解,通常需要将这些技术与其他测序技术和验证实验相结合,以串联起整个实验流程。这种多技术联用的方法能够提供多层次的数据,从而更好地理解基因调控网络、表观遗传学机制以及细胞功能。
2023年05月27日,复旦大学生物医学研究院/上海市医学表观遗传学重点实验室沈宏杰/徐文绮和牛津大学yang shi教授合作以“METTL14 regulates chromatin bivalent domains in mouse embryonic stem cells”为题在《cell reports》期刊发表研究论文,该研究以小鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cell,mESC)为研究对象,通过染色...
本研究通过多学科方法整合分子生物学、转录组学、表观遗传学和药物发现,揭示了GCs通过GR和TET2的共同调控促进CRC转移的分子机制,并提出了belinostat作为潜在的辅助治疗手段,并为CRC的新药开发提供了潜在的靶点。 研究亮点 揭示了GCs在CRC转移中的分子机制。