首先是这样的 image.png 选择右边的tracks(分析的人都知道,这一班就意味着各种data),分八个板块 image.png 比如我们想看组蛋白H3K27me3修饰,理所当然快捷选择antibody image.png 然后我这里选择看了水稻野生型DJ里面12天叶片的H3K27me3修饰 image.png 可以看到这个基因上几乎没有H3K27me3修饰 image.png 特别...
技术团队在国际上首创LHC-BS、HMST-seq、ChIP-BS、cfDNA-TBS等甲基化、羟甲基化技术流程,研发建立简化基因组甲基化dRRBS、cfDNA-RBS,单细胞/微量DNA全基因组甲基化及简化高通量甲基化测序技术,RNA甲基化测序等技术和方法,并建立易基...
图5. 使用针对 H3K4me1 的成岩节点抗体进行蛋白质印迹分析 对来自 HeLa细胞的全细胞(25 µg,泳道 1)和组蛋白提取物(15 µg,泳道 2)以及 1 µg 重组组蛋白 H2A 进行蛋白质印迹分析, H2B、H3 和 H4(分别为泳道 3、4、5 和 6)使用针对 H3K4me1 的 Diagenode 抗体(目录号 C15410037)。抗体在含...
×C15410021H4K5 ,8,12ac 抗体(50 μg)ChIP-qPCRChIP -seqCUT&TagDBELISAIFWB亲和纯化×C15410025H4K5ac抗体(50 μg)ChIP-qPCRChIP-seqCUT&TagDBELISAIFWB亲和纯化×C15410325-50HDAC1抗体(50 μg)ChIP-qPCRChIP-seqELISAIF蛋白质分析siRNA KnockdownWBAffin纯化后的 × C15410053HDAC1 抗体 - 替换为...
而UCSC Genome Browser是当前业内最有名、应用最广泛的基因组浏览器。今天大师姐就带着大家,尝试用这些网站探索特定修饰的组蛋白是否参与了目标基因的表达调控。这样的方法也同样适用于转录因子、染色质调控因子等蛋白与目标基因结合情况的分析。 当前已经有JASPAR等很多网站,能实现基于启动子区的序列、对目标基因的转录...
所属分类:生物信息学分析 联系电话:020-85625352 QQ:386244141 Email:servers@gzscbio.com 技术服务描述 1. CHIP-seq ChIP-Seq技术是研究蛋白质与DNA相互作用的有力工具,利用该技术可以检测转录因子与DNA的动态调控作用,各种组蛋白修饰,染色质调控因子等,转录因子与组蛋白修饰的ChIP-Seq示意图如下: ...
图3. 使用针对 CBX2 的成岩节点抗体进行蛋白质印迹分析使用针对 CBX2 的成岩节点抗体(目录号 C15410339)稀释后,通过蛋白质印迹分析 HeLa 细胞的全细胞提取物1:1,000 在含有 5% 脱脂牛奶的 TBS-Tween 中。右侧标明了目的蛋白的位置;标记(以 kDa 为单位)显示在左侧。 图4. 使用针对 CBX2 的 Diagenode ...
例如H3K4me2和H3K4me3修饰大多数富集在转录起始位点附近的启动子上激活基因表达,而H3K27me2和H3K27me3与基因抑制相关。因此可通过CHIP-seq分析组蛋白修饰的分布寻找基因的启动子区和增强子区域及其是激活或抑制基因表达。 H3K4me1可作为增强子的标志,H3K4me3作为启动子标志。研究表明,H3K4me1和H3K4me3与基因激活相关,...
鉴定得到差异peak后,再利用R包ChIPseeker对得到的差异peak进行注释、分布统计,利用软件HOMER进行motif鉴定等分析。 04 染色质免疫共沉淀测序实验成功的关键问题 (1)抗体质量 ChIP-seq是基于抗体的免疫沉淀实验,因此它的数据质量好坏直接取决于抗体的质量...
lncRNA-seq数据分析之新lncRNA鉴定和注释视频课程众筹 视频观看方式 首先视频免费共享在B站:bilibili.com/video/BV16 同步查看视频配套代码 : jianshu.com/p/1384173c3 ChIP-SEQ实战演练的素材:链接:share.weiyun.com/53CwQ8 密码:ju3rrh, 包括一些公司PPT,综述以及文献。 ChIP-SEQ 实战演练的思维导图:文档链...