cChIP-seq为载体辅助ChIP seq,这里的载体的作用是: 1、添加组蛋白载体,该组蛋白含有目标染色质的一些抗原位点,以增加样本体系中蛋白质的量,解决抗体、磁珠以及染色质比例不均的问题。 2、所添加载体为不含DNA的组蛋白,IP后纯化的DNA样本无需特殊操作,就能够直接进行建库扩增。 (2)方法 1、准备10000个细胞样本,...
为研究组蛋白修饰在HT条件下对雄性育性的可能贡献,本研究通过染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)在两个不同品种的陆地棉(Gossypium hirsutum)中绘制了组蛋白H3赖氨酸27三甲基化(H3K27me3)和组蛋白H3-赖氨酸4三甲基化(H3K4me3)的组蛋白甲基化图谱。分析结果表明,在高温处理的棉花花药中,H3K4me3和H3K27me3修饰,特别是H...
将ChIP与高通量测序技术相结合的ChIP-Seq技术,可在全基因组范围对特定蛋白的DNA结合位点进行高效而准确的筛选与鉴定,为研究的深入开展打下基础。 DNA与蛋白质的相互作用与基因的转录、染色质的空间构型和构象密切相关。运用组蛋白特定修饰的特异性抗体或DNA结合蛋白或转录因子特异性抗体富集与其结合的DNA片段,并进行纯化...
组蛋白甲基化修饰工具(H3K4me3 ChIP-seq)组蛋白甲基化类型也有很多种,包括赖氨酸甲基化位点H3K4、H3K9、H3K27、H3K36、H3K79和H4K20等。组蛋白H3第4位赖氨酸的甲基化修饰(H3K4)在进化上高度保守,是被研究最多的组蛋白修饰之一。 DNA亲和纯化测序DNA亲和纯化测序技术通过体外表达转录因子鉴定转录因子结合位点,不受...
研究摘要: 高温胁迫导致作物雄性不育,从而降低产量。为研究组蛋白修饰在HT条件下对雄性育性的可能贡献,本研究通过染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)在两个不同品种的陆地棉(Gossypium hirsutum)中绘制了组蛋白H3赖氨酸27三甲基化(H3K27me3)和组蛋白H3-赖氨酸4三甲基化(H3K4me3)的组蛋白甲基化图谱。分析结果表明,在高...
本研究采用的微量细胞ChIP-seq技术(LCNChIP-seq),利用约10000个减数分裂前期Ⅰ的水稻花粉母细胞,绘制了全基因组H3K4me3和H3K27me3的组蛋白修饰图谱,两个标记各设置2个生物学重复。分别鉴定出25715个H3K4me3和16414个H3K27me3可重复peaks,其中3598个两种修饰标记同时存在的基因组位点,称为H3K4-K27me3,表明该时期...