ChIP-seq和转录组关联分析可以做以下2个方面的研究:1、DNA结合蛋白和基因表达调控:通过ChIP-seq技术可以确定DNA结合蛋白(如转录因子)的结合位点,然后与转录组数据结合分析,可以获得转录因子直接调控的靶基因,为全面理解转录因子调控功能提供依据。2、组蛋白修饰和基因表达:ChIP-seq可以用于鉴定组蛋白修饰的位点,结合转录...
ChIP-seq项目文章 1、通过锌指结构插入激活特定DNA位点上的重组酶 文章题目:Activation of recombinases ...
随后,利用染色质免疫沉淀偶联深度测序(ChIP-seq),作者发现CtrA与211个基因的启动子区结合,包括gst、gshA和gshB并激活这些基因的表达,而这些基因的表达降低能够抑制E.chaffeensis应对氧化应激。 作者的研究结果表明,E.chaffeensisCtrA通过结合gst、gshA和gshB调节GSH的利用,这在抵抗氧化应激中起着关键作用,并有助于开发HM...
易基因项目文章 ChIP-seq 揭... 喜报: 易基因细胞转录抑制因子 ChIP-seq 研究成果见刊《Nucleic Acids Research》 2022 年 6 月 10 日,中国医学科学院药物生物技术研究所丁寄葳 副研究员为第一作者、岑山和李晓宇为共同通讯作者的研究团队以 “Schlafen 5 suppresses human immunodeficiency virus type 1 transcr...
写在前面:《一篇文章学会ChIP-seq分析(上)》《一篇文章学会ChIP-seq分析(下)》为生信菜鸟团博客相关文章合集,共九讲内容。带领你从相关文献解读、资料收集和公共数据下载开始,通过软件安装、数据比对、寻找并注释peak、寻找motif等ChIP-seq分析主要步骤入手学习,最后还会介绍相关可视化工具。
嘉因生物2014年成立以来,已经累计完成3000多例ChIP-seq项目。2嘉因生物-ChIP-seq热点追踪与往期回顾组蛋白乳酸化研究切入点(上)——乳酸化水平检测方法及指标组蛋白乳酸化研究切入点(中)——乳酸自身的检测方法及指标组蛋白乳酸化研究切入点(下)-乳酸代谢异常指标的检测方法客户文章速递:IF 12.658丨ChIP-seq和...
易基因|植物育种:ChIP-seq(组蛋白)揭示H3K36me修饰影响温度诱导的植物可变剪接和开花 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 2017年,荷兰瓦格宁根大学分子实验室RGH Immink团队以“Histone H3 lysine 36 methylation affects temperature-induced alternative splicing and flowering in plants”...
该研究通过ChIP-seq等实验揭示了烟粉虱(whitefly Bemisia tabaci)含菌细胞共生菌Hamiltonella通过调控卵巢线粒体功能决定后代性比的共生菌调控宿主生殖的表遗传机制。深圳易基因科技为本研究提供ChIP-seq测序分析服务。 标题:A bacteriocyte symbiont determines whitefly sex ratio by regulating mitochondrial function 烟...
写在前面:《一篇文章学会ChIP-seq分析(上)》《一篇文章学会ChIP-seq分析(下)》为生信菜鸟团博客相关文章合集,共九讲内容。带领你从相关文献解读、资料收集和公共数据下载开始,通过软件安装、数据比对、寻找并注释peak、寻找motif等ChIP-seq分析主要步骤入手学习,最后还会介绍相关可视化工具。
ChIP-seq或染色质免疫沉淀和测序是一种技术,允许研究人员通过在全基因组范围内绘制蛋白质-DNA相互作用和表观遗传标记来理解转录调控。与以前的方法相比,ChIP-seq具有几个优点,例如ChIP芯片,但与所有技术一样,ChIP-seq也有其局限性。 ChIP-seq ChIP-seq是下一代测序的首批应用之一,该测序是在2000年代中期开发的。其...