HOCOMOCO是专门研究人和小鼠的数据库,团队从超过5000个针对人类和小鼠转录因子的实验中获得的14000多套ChIP-Seq数据集,基于系统化的基序发现和交叉验证,展示了人类和小鼠转录因子结合模型。目前,HOCOMOCO 共收集了680个人和453个鼠转录因子的结合model,其中包含1302个单核苷酸和576个二核苷酸的位置权重矩阵。这种大规模的...
下面步入正题,这套流程从ChIP-实验、测序注意事项、测序深度,到分析整体流程,再到每一步如序列比对,富集效率评估、热图、峰图可视化,deeptools2使用、peak calling和motif分析等。
ChIP-Atlas:基于公共chip_seq数据进行分析挖掘 Cistrome DB:人和小鼠的chip_seq数据库 chipBase:转录因子调控网络数据 unibind:human转录因子结合位点数据库 chip_seq也常被用来研究增强子和超级增强子 DENdb:human增强子数据库 V...
HOCOMOCO是专为研究人类和小鼠设计的数据库,基于对超过5000个针对两者转录因子的实验收集的14000多个ChIP-Seq数据集,通过系统化的基序发现和交叉验证,揭示了人类和小鼠转录因子的结合模型。HOCOMOCO目前汇集了680个人类和453个鼠的结合模型,包含了1302个单核苷酸和576个二核苷酸的位置权重矩阵。这大规模的...
百度试题 结果1 题目存放ChIP-seq分析得到的结合位点/区域信息的数据库属于二级数据库。()A、对B、错 相关知识点: 试题来源: 解析 A 反馈 收藏
ENCODE数据库中,哪个工具可以用于分析ChIP-seq数据()。 A. ChIPseeker B. MACS2 C. Homer D. All of the above 题目标签:工具数据库如何将EXCEL生成题库手机刷题 如何制作自己的在线小题库 > 手机使用 分享 反馈 收藏 举报 参考答案: D 复制 纠错...
存放ChIP-seq分析结果峰值的数据库属于二级数据库A.正确B.错误的答案是什么.用刷刷题APP,拍照搜索答疑.刷刷题(shuashuati.com)是专业的大学职业搜题找答案,刷题练习的工具.一键将文档转化为在线题库手机刷题,以提高学习效率,是学习的生产力工具
生信学霸揭秘生信分析的全流程!1. 下载数据选择数据源:常用的数据库有GEO、TCGA、ENSEMBL等。确定数据类型:根据研究需求选择适合的RNA-seq、ChIP-seq、ATAC-seq等数据类型。数据下载工具:使用SRA To - 科研生信SCI于20240722发布在抖音,已经收获了1353个喜欢,来抖
HOCOMOCO是专门研究人和小鼠的数据库,团队从超过5000个针对人类和小鼠转录因子的实验中获得的14000多套ChIP-Seq数据集,基于系统化的基序发现和交叉验证,展示了人类和小鼠转录因子结合模型。目前,HOCOMOCO 共收集了680个人和453个鼠转录因子的结合model,其中包含1302个单核苷酸和576个二核苷酸的位置权重矩阵。这种大规模的...
HOCOMOCO是专门研究人和小鼠的数据库,团队从超过5000个针对人类和小鼠转录因子的实验中获得的14000多套ChIP-Seq数据集,基于系统化的基序发现和交叉验证,展示了人类和小鼠转录因子结合模型。目前,HOCOMOCO 共收集了680个人和453个鼠转录因子的结合model,其中包含1302个单核苷酸和576个二核苷酸的位置权重矩阵。这种大规模的...