ChIP-Seq:用于构建目的蛋白的DNA互作组数据,或用于不同遗传背景/实验条件下的互作组差异。 ChIP-qPCR:用于验证目的蛋白和候选DNA的相互作用关系,或用于不同遗传背景/实验条件下的互作变化。 ChIP-Seq检测和ChIP-qPCR验证技术价值: (1)蛋白与DNA相互作用数据,是探究转录调控机制研究的重要内容,体现机制研究的深度,能...
f. 使用 DNA 纯化离心柱从样品中纯化 DNA。 g. 纯化的DNA冻存于-20℃;用于qPCR验证或测序; 5. qPCR检测: 将Mix在4℃下融解,轻柔地上下颠倒混匀并进行短暂离心; 冰上配制下表中的反应液: c. 将反应管进行短暂离心,确保所有反应液在反应孔底部。 d. 采用三步法程序进行反应: 循环数步骤温度时间荧光采集 ...
ChIP-Seq互作组验证,即在互作组分析筛选的基础上,进一步利用ChIP-qPCR技术对感兴趣分子进行靶向检测,更加精细,也是互作组验证的必由之路。成功验证上岸的基础是理想的互作组数据库和丰富的分析经验,方能事半功倍。广州基云生物,在IP互作组检测和关键机制分子筛选验证领域,具有丰富的经验,助力互作机制研究。如有...
对于富集类实验,老师可以根据前期seq的结果预测的motif对应的peak两端序列进行引物设计(1),或者利用可视化的软件(如IGV)对peak最明确的位置对应的序列进行引物设计(2)。若前期未进行seq实验,也可利用一些ChIP数据库(如Cistrome DB)查看其他学者是否有进行对应蛋白的ChIP实验,利用别人的结果进行验证(3)。此外,若研究的...
ChIP-Seq/q..ChIP-Seq检测和ChIP-qPCR验证要点:(1)实验设计:尽量进行实验组别设计和生物学重复检测,提高后续验证的阳性率。常规过表达单组(Ab IP vs IgG IP);动态互作组学(实验组vs
染色质免疫共沉淀测序(chip-seq) 简介 染色质免疫沉淀技术(Chromatin immunoprecipitation assay, ChIP)是目前唯一研究体内 DNA 与蛋白质相互作用的方法,主要包括 ChIP-qPCR 和 ChIP-seq 两种。利用 ChIP-seq 技术能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白修饰、转录因子等互作的 DNA 区段。 原理 真核生物的基因组 ...
辉骏生物使用ChIP-qPCR、ChIP-seq等技术在染色质免疫共沉淀ChIP研究实验技术服务超10年,公司在DNA与蛋白相互作用研究方面经验丰富,自有实验场地,ChIP外包代作服务价格优惠,实验数据已协助发表上千位客户发表高分论文
此外,染色质免疫沉淀 (ChIP-seq+ChIP-qPCR)检测结果表明SLFN5通过与U5-R区域的两个序列结合,显著降低HIV-1长末端重复序列(LTR)的转录活性,从而抑制RNA聚合酶II(RNA PoL II)向转录起始位点募集。诱变研究验证了核定位序列和N-末端1-570氨基酸片段在抑制HIV-1中的重要性。进一步机制研究表明,SLFN5与PRC2复合物、...
8.95℃,10minto decrosslink protein from DNA fragment, and1%agaroseelectrophoretic analysis(actually, we will get the size from <100bp, or 100-200bp)(Tips: during test, samples should be kept at 4℃instead of ice bath) 9.If the size of DNAfragment met ChIP grade requirement, then continue...
此外,染色质免疫沉淀 (ChIP-seq+ChIP-qPCR)检测结果表明SLFN5通过与U5-R区域的两个序列结合,显著降低HIV-1长末端重复序列(LTR)的转录活性,从而抑制RNA聚合酶II(RNA PoL II)向转录起始位点募集。诱变研究验证了核定位序列和N-末端1-570氨基酸片...