本研究结果显示BRWD3敲除不仅会导致H3K4me1水平增加,还会导致H3K4me 水平降低,表明BRWD3对H3K4甲基化的影响具有广泛性。通过免疫沉淀结合定量质谱分析鉴定出BRWD3与H3K4特异性组蛋白去甲基化酶5(KDM5/Lid)之间的相互作用,KDM5是一种从H3K4中去除三甲基和二甲基标记的酶。此外染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)数据分析...
本研究结果显示BRWD3敲除不仅会导致H3K4me1水平增加,还会导致H3K4me 水平降低,表明BRWD3对H3K4甲基化的影响具有广泛性。通过免疫沉淀结合定量质谱分析鉴定出BRWD3与H3K4特异性组蛋白去甲基化酶5(KDM5/Lid)之间的相互作用,KDM5是一种从H3K4中去除三甲基和二甲基标记的酶。此外染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)数据分析...
另外,在之前的文章中给大家介绍的关于ChIP-seq的应用还包括检测DNA的甲基化,但是小远找了很久没有找到相关的文献,对于检测DNA甲基化的研究用到的方法包括:亚硫酸氢盐修饰后测序法(BSP)、亚硫酸盐修饰后的限制性内切酶法(COBRA)、甲基化特异性的PCR法(Methylation-Specific PCR,MSP)、NGS甲基化测序法、HRM(高分辨率...
在表观研究领域,有两大经典测序产品经久不衰,一直是广大科研工作者的发文利器,即染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)和全基因组甲基化测序(WGBS)。这两种常用的高通量测序技术,在分子生物学和遗传学研究中有着广泛的应用领域,包括疾病的发生发展、胚胎发育、癌症研究和动植物性状研究等。 诺禾致源一直以助力客户发文为...
本研究应用MeRIP-seq,ChIP-seq,RNA-seq等技术,通过敲除N-Myc以及抑制 mTOR 诱导胚胎干细胞暂停发育等手段,探索RNA修饰在休眠期转录休眠调控中的潜在功能,发现小鼠胚泡和胚胎干(ES)细胞的发育暂停需要 Mettl3 对 N6 -甲基腺苷(m6A)RNA 进行甲基化,并且揭示了Mettl3对发育暂停期间的整体转录起抑制作用,其染色质招募...
另外,在之前的文章中给大家介绍的关于ChIP-seq的应用还包括检测DNA的甲基化,但是小远找了很久没有找到相关的文献,对于检测DNA甲基化的研究用到的方法包括:亚硫酸氢盐修饰后测序法(BSP)、亚硫酸盐修饰后的限制性内切酶法(COBRA)、甲基化特异性的PCR法(Methylation-Specific PCR,MSP)、NGS甲基化测序法、HRM(高...
本研究应用MeRIP-seq,ChIP-seq,RNA-seq等技术,通过敲除N-Myc以及抑制 mTOR 诱导胚胎干细胞暂停发育等手段,探索RNA修饰在休眠期转录休眠调控中的潜在功能,发现小鼠胚泡和胚胎干(ES)细胞的发育暂停需要 Mettl3 对 N6 -甲基腺苷(m6A)...
1、ChIP-seq可以研究组蛋白的修饰情况,以剖析表观遗传特征和生物学功能; 2、 ChIP-seq可用来研究转录因子结合位点,解析该转录因子作用的通路信息; 3、ChIP-seq技术可得到核小体的定位图谱,核小体定位在转录调控,DNA复制和修复等多种细胞过程中并起着重要作用; 4、ChIP-seq技术可研究DNA的甲基化情况,DNA甲基化会...
另外,在之前的文章中给大家介绍的关于ChIP-seq的应用还包括检测DNA的甲基化,但是小远找了很久没有找到相关的文献,对于检测DNA甲基化的研究用到的方法包括:亚硫酸氢盐修饰后测序法(BSP)、亚硫酸盐修饰后的限制性内切酶法(COBRA)、甲基化特异性的PCR法(Methylation-Specific PCR,MSP)、NGS甲基化测序法、HRM(高...
I-M. 点图分别以G和H表示ATAC-seq值的量化。K–M精度召回曲线分别表示亚型特异性PMD(K)、DMR(L)或两者(M)的平均甲基化。 研究小结 本研究强调了正常细胞类型中存在细胞类型特异性的PMDs和DMRs,这些细胞类型在恶性细胞中得以保留。本研究是首次展示PMDs在正常、前体和恶性状态下的显著细胞类型特异性。虽然先前的...