首先ChIP指染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP),seq 指的是二代测序,那么ChIP-seq实际上也就是染色质免疫共沉淀+二代测序的一个过程。二代测序大家应该不陌生,但是什么是染色质免疫共沉淀技术?目前的ChIP-Seq研究主要包括两大类应用——TF(转录因子)和Histone(组蛋白) ChIP 什么是染色质免疫共...
ChIP-seq(Chromatin Immunoprecipitation Sequencing)是一种高通量测序技术,用于研究蛋白质-DNA 相互作用和基因组中的染色质修饰。它结合了免疫沉淀和测序技术,广泛应用于基因组学和表观遗传学研究。 chip-seq的分析流程包括一下步骤: 1. ChIP 实验步骤 1.1 交联和裂解 交联:使用化学交联剂(如甲醛)将蛋白质与 DNA ...
Chip-seq是实验前明确有一个感兴趣的转录因子,根据目标转录因子设计抗体去做Chip-seq实验拉DNA,验证感兴趣的转录因子是否与DNA存在相互作用;而ATAC-Seq一般用于不知道特定的转录因子,是在全基因组范围内检测染色质的开放程度,可以得到全基因组范围内的蛋白质可能结合的位点信息,用这个技术方法与其他方法结合是想去筛感...
ChIP-Seq即染色质免疫共沉淀-高通量测序,是指通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集与目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化和文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序,是目前在全基因组水平研究蛋白结合靶DNA序列的重要手段,为转录因子、组蛋白修饰等表观遗传学的研究提供有效方法。 Q2ChIP-Seq实验流程?
染色质免疫沉淀后测序(ChIP seq)是一种针对DNA结合蛋白、组蛋白修饰或核小体的全基因组分析技术。由于...
Chip-Seq：一种转录组学研究技术 答案解析：Chip-Seq技术定义：是一种高通量的生物学研究方法，用于研究基因组中特定区域的转录情况。它通过结合基因芯片和大规模测序技术，实现对基因表达水平的大规模并行分析。这种技术特别适用于研究基因表达调控、转录因子结合位点以及基因变异对表达的影响等领域。详细解释...
细菌样本ChIP-seq属于风险项目，提取建库失败率均较高；真菌属于风险物种，尤其是转录因子类的，建议送...
-, 视频播放量 3、弹幕量 0、点赞数 0、投硬币枚数 0、收藏人数 0、转发人数 0, 视频作者 扌戈课钾arg653, 作者简介 ,相关视频:单细胞双疾病联合bulk转录组测序GSEA富集分析CIBERSORT免疫浸润,单细胞测序研究数据挖掘分析 转录组RNA scRNAseq 二代测序自,美女大学生口腔
理解了上面的测序深度和覆盖度的概念,我们就可以根据它们来区分WGS,WES,RNA-seq组与ChIP-seq,简单地说就是搞清楚这些组学要测什么,而且测多深即可。 全外显子(Whole-exome sequencing): 首先外显子组(Exome)是指真核生物基因组中全部外显子区域的总和,包含了蛋白质合成最直接的信息。外显子 组测序(Exome-...
ChIP-seq服务流程 客户在线下单——订单/实验材料确认——细胞培养——1%甲醛交联蛋白-DNA复合物——超声打断蛋白-DNA复合物——抗体沉淀蛋白-DNA复合物——解交联并纯化DNA片段——文库构建——Hiseq上机测序、数据质控 其中文库构建流程：（1）DNA片段末端修复；（2）3’端加A碱基；（3）连接测序接头；（4）PCR...