chip的基本原理是在活细胞状态下,固定蛋白质-DNA(染色质)复合物,并将其切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法(抗体亲和)沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA 片段,通过对目的片段的纯化与后期检测,从而获得蛋白质与DNA 相互作用的信息。一、ChIP实验原理 染色质免疫共
PCR的原理基于DNA的复制和酶的催化作用。 PCR通常由三个步骤组成:变性(Denaturation),退火(Annealing)和延伸(Extension)。在变性步骤中,DNA双链被加热至高温,使其解开成两条单链DNA。在退火步骤中,温度降至稍低,并引入PCR引物(引物是两侧与目标DNA序列互补的短DNA片段),引物会与目标DNA序列上的两个互补区域结合。
· 实验数据的分析需考虑到实验的技术变异,包括PCR扩增效率的变异和样本处理过程中的损失。因此,实验设计中包含重复实验以及适当的负对照是必要的。· ChIP实验的结果可以直接应用于基因表达调控的研究,如分析特定转录因子在不同生物学条件下的DNA结合位点变化,揭示其在生理或疾病状态下的功能角色。· 此外,ChIP-se...
ChIP 实验的优势在于能够捕捉系统中特定蛋白质-DNA 相互作用,并使用定量聚合酶链反应(qPCR)对相互作用进行量化。染色质免疫沉淀实验需要多种蛋白质组学和分子生物学方法,包括交联、细胞裂解(蛋白质-DNA 提取)、核酸剪切、抗体免疫沉淀、DNA 样本回收和 PCR...
得到的DNA可以通过PCR检测目标区域的DNA是否被目的蛋白富集,或者通过DNA测序的方式检测目的蛋白在全基因组上的分布; ChIP原理看似简单,但要想做好ChIP ,得到高质量的数据却绝非易事。 ChIP的应用方向: DNA甲基化 蛋白质甲基化 组蛋白修饰 ChIP实验步骤可分6步: ...
Chip qPCR的原理基于聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR),PCR是一种通过DNA聚合酶扩增目标DNA的技术。而Chip qPCR则是在PCR基础上,结合了微流控芯片和光学检测技术,实现了高通量定量PCR分析。二、Chip qPCR的关键步骤 1.样本制备 首先,需要从待分析的样本中提取目标DNA,并根据实验需求进行纯化和稀释...
ChIP 背后的原理相对较为直接,并依赖于使用一种抗体从细胞或组织提取物蛋白混合物中分离某种蛋白、组蛋白、转录因子或辅因子及其结合的染色质,或使之沉淀。因此,这种技术的名称为:染色质免疫沉淀法。在 ChIP-PCR 或ChIP-seq 中,使用广泛提供的 PCR 或 qPCR 试剂和下一代测序 (NGS) 技术便能检测和定量免疫富集...
㈢洗涤步骤:洗涤步骤是去除非特异性结合的关键,需根据实验需求调整洗涤液的种类和次数,以确保背景信号最小化。 ㈣qPCR分析:选择合适的内参和特异性引物,确保qPCR分析的准确性和可靠性。同时,需考虑实验的技术变异,包括PCR扩增效率的变异和样本处理过程中的损失。