ChimeraX是一个功能强大的分子可视化和分析软件,它能够精确地展示蛋白质与配体之间的相互作用,包括氢键和接触点。在本教程中,我们将介绍如何使用ChimeraX工具,通过可视化和分析蛋白质的结构,揭示药物分子如何与靶标蛋白发生氢键相互作用和接触。这些信息不仅有助...
transparency70target c 最后,我们点击File→Save,可以保存ChimeraX session*.cxs文件,以便于后续继续在ChimeraX中对图片进行修改;如果需要导出为图片,可以选择*.jpg、*.png或*.tif格式。这样,一副可用于文章发表的插图就绘制完成啦,最后经过简单地拼接...
AIDD Pro ChimeraX使用教程【03】单链蛋白的同源建模 AIDD Pro 手把手教你使用ChimeraX进行蛋白-配体相互作用的分析与绘图(上篇) AIDD Pro 【实验技术】蛋白质不表达常见原因及分析 普拉特泽生物打开知乎App 在「我的页」右上角打开扫一扫 其他扫码方式:微信 下载知乎App 开通机构号 无障碍模式 验证码登录 密码登录...
首先，将所需的蛋白质结构模型文件下载至本地。随后，在ChimeraX中，选择File菜单下的open选项，即可打开并导入该文件。以人源去甲肾上腺素转运蛋白为例，其PDB代码为8HFF，可直接通过此方法导入。此外，若想下载PDB库中已存在的蛋白质结构，只需在ChimeraX的命令行中输入相应的PDB代码，如open 8HFF，系统将自动完...
今天向各位知友介绍的ChimeraX是由美国加州大学旧金山分校(University of California San Francisco,简称UCSF)的生物计算、可视化和信息学资源(Resource for Biocomputing, Visualization, and Informatics,简称RBVI)团队开发的一个开源分子可视化软件。 ChimeraX定位为下一代分子可视化软件(它的前身是RBVI以前开发的旧版分子可...
ChimeraX®循环肿瘤细胞分析工作站,是骏实生物自主研发的一款全自动细胞分选系统,配合分选试剂,可自动完成细胞固定、透化、染色和分选的所有步骤,实现靶细胞的富集。染色后的靶细胞可采用全自动荧光扫描仪进行扫描和成像,通过配套分析软件,进行细胞的识别、计数及相关多组学检测。
Chimerax are easily recognisable due to their upgraded turrets that mount four lightautocannons. These allow the Chimerax to lay down a curtain of fire highly effective at keeping infantry, light skimmers and flyers at bay. However, unlike theHydra, the Chimerax does not carry the complex trac...
ChimeraX是一款功能强大的分子可视化与分析软件,广泛应用于生物学、化学、药学等领域,尤其在结构生物学中表现出色。它支持多种分子数据格式,提供直观的图形界面和强大的命令行功能,能够处理蛋白质、RNA等分子的三维结构,并支持多种显示方式。以下是对ChimeraX的详细解析。 软件功能与应用领域 Chimera...
1. ChimeraX操作指南 1.1. 导入蛋白质结构模型 通常，我们可以从PDB数据库下载所需的蛋白质结构文件，再导入到ChimeraX中进行可视化与分析。然而，这种做法相对繁琐。若已知目标蛋白的PDB标识符，可直接在ChimeraX的命令行中输入特定指令，实现文件的自动导入，极大提升了使用的便捷性。1.2. 通过链进行着色 在...
使用ChimeraX导入所需的蛋白质结构文件，例如PDB文件。通过鼠标控制或Log窗口快速选择并观察三维结构。生成疏水性表面：ChimeraX根据原子坐标、原子亲脂性参数和距离依赖函数计算“分子亲脂性势”。输入相关命令生成默认从深青色到白色再到深黄色的疏水性表面。调整计算方法和着色方案：MLP命令提供多种计算方法...