cfDNA研究和应用是精准医疗和液体活检领域的重要方向之一。 02.技术优势 03.样本选择及送样要求 样本选择 血浆样本:血浆能避免所含血细胞裂解引起的DNA 污染,是cfDNA 检测的优先选择。 脑脊液样本:通常作为中枢神经系统疾病研究的样本选择。 尿液样本:常用于泌尿系统癌症如膀胱癌、肾癌等肿瘤标志物研究及移植排异监测等...
LabChip cfDNA assay是一种可靠的高通量、自动化、易用型检测方法，可在1.5小时内对一次芯片制备中多达96个cfDNA样本的浓度和片段大小进行量化检测，并提供cfDNA样本中污染物的定性信息。图2. cfDNA实验的LOD和线性测试 A）连续稀释液中cfDNA样本（起始浓度为50-1000pg/μL）定量结果：电泳图所示为连续稀释样本的c...
CfDNA超低测序深度也可保存细胞类型特征信息。图片来源：Nature communications健康人血浆中cfDNA的细胞类型组成结果显示，所有测序深度的健康个体血浆中的cfDNA样本与免疫细胞类型的相关性最强，其次是内皮细胞、基质细胞和上皮细胞类型(图D)。健康状态下单核细胞和淋巴细胞对cfDNA的贡献最大，特别是单核细胞、调节性T细胞...
检测到cfDNA中癌症相关突变、拷贝数变异和异常甲基化信号与各种癌症类型的总生存期(OS)和/或无进展生存期(PFS)相关。治疗后的肿瘤cfDNA含量降低是一个潜在的生物标志物,有助于改善疗效和预后,而治疗后cfDNA回升或持续提示癌症复发。cfDNA的甲基化信号已经被证明可以检测癌症,并将癌症区分为具有不同生存结局的高危和低...
近日,《新英格兰医学杂志》(NEJM)发表了一项研究,表明游离DNA(cfDNA)血液检测法在结直肠癌筛查中展现出良好的灵敏度和特异性。 试验方法 这是一项在美国开展的多中心(265个入选单位)、前瞻性、观察性研究,旨在一般风险人群中,评估cfDNA血液检测法对无症状和早期...
血浆中的游离DNA(cfDNA)来源于细胞受损破裂后释放的DNA,经由核酸酶裂解成约160nt大小的片段,其产生和清除是一个动态过程(半衰期约为5~150分钟)。而这种“全局快照”能力使其成为许多疾病的理想分子标志物。作为对影像学和组织活检的补充手段,近年来,cfDNA检测被越来越多的应用到肿瘤诊断领域。肿瘤基因组通常会携带特...
传统基于化学转化方式研究DNA甲基化的WGBS技术会损伤DNA,且所需样本量较高;诺禾致源推出的基于酶法转化法的EM-seq技术,专注于ng级别微量尤其cfDNA领域DNA甲基化研究,单碱基分辨率检测基础上实现全基因组范围的甲基化情况鉴定,仅需10ng,是cfDNA液体活检疾病标志物的绝佳利器。
游离DNA(cfDNA) 测序作为一种无创方法已用于确定癌症的基因组图谱、监测微小残留病并可能及早发现癌症。由于cfDNA是循环正常DNA和肿瘤来源DNA的混合物，只能通过比较白细胞(WBC) 等深度匹配测序来明确确定血浆中检测到的突变来源，但这种方法成本过高。因此，需要开发一种在未收集匹配血液测序数据的情况下能在cfDNA测序...
细胞游离DNA（cfDNA）携带起源组织的信息特征，包括基因组改变、DNA修饰和细胞类型特异性片段化模式等。其中，DNA甲基化是泛癌筛查研究中很有应用前景的cfDNA生物标志物。近年来，以Oxford Nanopore Technologies（ONT）为代表的纳米孔测序技术日渐成熟，其在DNA甲基化检测的准确性上也已被证实，可以产生高分辨率的单碱基...
有研究表明，联合检测肿瘤的突变、甲基化等多组学标志物可以显著提高癌症检测的效果【1】。当前大多数cfDNA检测技术仅能分析单个组学的标志物，而一次抽血提取到的cfDNA通常只够做一次检测。因此，多数既往cfDNA研究只报道了单个组学的标志物，难以比较不同类型的标志物在不同研究、不同队列中的表现，也难以结合多种标志...