所以,今天小编就给大家介绍一个特别优秀的数据库:CellMarker(http://biocc.hrbmu.edu.cn/CellMarker/index.jsp),直接通过点点点,就能查看哪些细胞的标志物/基因是什么,是不是瞬间感觉高大上~ 该数据库通过手动收集超过100,000篇发表的论文,涵盖细胞标志物信息,组织类型,细胞类型,癌症信息和来源等4,124个条目。共...
一张图总结一下CellMarker 2.0数据库概况:👇 3CellMarker 2.0 更新亮点 本次更新的亮点如下:👇 新增36300个tissue-cell type-marker条目、474个组织、1901个细胞类型和4566个marker; 新增48种测序技术分类的细胞marker,包括10×Chromium、Smart-seq2和Drop-seq等; 新增29种细胞Marker,包括蛋白编码基因,lncRNA和p...
并且提供了新的工具:ACT(Annotation of Cell Types)网页,之前在细胞亚群在线注释网站使用就主要用到了ACT网页! CellMarker网站主要页面 Home 在主页中展示的是人和鼠的全局图谱,然后标注了不同的器官和细胞类群,点击即可快速检索,浏览Marker基因 并且对CellMarker进行了简介和概述,对于我们能用cellMarker做什么也简单的...
细胞标志物(Cell Marker)是用来对细胞定义和分选的重要标志,无论是在流式细胞术等湿实验对特定细胞类型进捕获,还是在单细胞测序数据中精确鉴定细胞类型,都需要借助Cell Marker。因此,CellMarker数据库在2018年应运而生。近期,CellMarker 2.0数据库升级版在Nucleic Acids Research发布,新增一系列单细胞测序数据分析相关的...
📚 探索CellMarker:一个汇集了超过100,000篇已发表文献中4,124个细胞标志物信息的数据库。这个数据库不仅包含人细胞类型的信息,还涵盖了鼠细胞类型的数据。👀 你可以轻松浏览、搜索和下载这些信息,无论你是科研工作者还是学生,都能在这里找到有用的资源。💡 数据库中收录了158种组织/亚组织的467种人细胞类型...
CellMarker:单细胞转录组测序定义细胞群体之利器 生物学中最基本的问题之一就是哪种类型的细胞以功能协调的方式形成不同的组织和器官,单细胞RNA测序技术的发展使得科研人员可以在单细胞分辨率下研究细胞表型和细胞行为,其发展潜力巨大。单细胞RNA测序技术最有吸引力的应用之一是解码复杂的细胞异质性,并创建不同组织/器官...
🔬 细胞标志物(CellMarker)在细胞研究和单细胞测序中扮演着至关重要的角色。它们不仅用于流式细胞术等实验方法中特定细胞类型的捕获,还在单细胞测序数据分析中帮助精确鉴定细胞类型。🌱 CellMarker数据库自2018年成立以来,一直致力于提供细胞标志物的相关信息。最近,CellMarker2.0在Nucleic Acids Research上发表,带来了...
全自动智能宫颈癌HPV筛查系统:PathfinderTM CellScan与Wellscan系统与 CellMarker应用分析模块的组合,是模块化和快速高容量筛选设备的核心筛选技术,满足不同领域的需求如基础研究,药物研发和毒性筛选等。其主要特点之一是其*的灵活性使其在同一仪器上对培养细胞或涂片,组织片段和微孔板进行分析(使用特殊的样品进样器)。
导航栏的“Download”界面可以下载网站收录的所有Marker,开发者真的是太nice了。 此外,如果你有新的数据或发现新的细胞marker也可以通过导航栏的“Submit”进行上传,经过开发者审核通过后会被网站收录。 参考文献: Zhang X, Lan Y, Xu J, et al. CellMarker: a manually curated resource of cell markers in ...
🎓 探索科学世界的大门时,我发现了一个宝藏网站——CellMarker。这个网站通过人工整理超过10万篇发表的论文,记录了4124个条目,涵盖了细胞标记信息、组织类型、细胞类型、癌症信息和来源。🔍 浏览和搜索 你可以在CellMarker上浏览人类和小鼠不同组织的细胞标记物,或者在感兴趣的组织中检索特定细胞类型的标记物。通过...