一张图总结一下CellMarker 2.0数据库概况:👇 3CellMarker 2.0 更新亮点 本次更新的亮点如下:👇 新增36300个tissue-cell type-marker条目、474个组织、1901个细胞类型和4566个marker; 新增48种测序技术分类的细胞marker,包括10×Chromium、Smart-seq2和Drop-seq等; 新增29种细胞Marker,包括蛋白编码基因,lncRNA和p...
CellMarker数据库收录了158种组织/亚组织的467种人细胞类型, 81种组织/亚组织的389种鼠细胞类型。数据主要来源于文献和数据库,包括单细胞测序数据和生物实验数据。 CellMarker数据库:http://biocc.hrbmu.edu.cn/CellMarker/ CellMarker数据库主界面: 点击细胞或组织可以快速查找标志物: 例如点击Human的Astrocyte标志...
我们可以通过两个搜索面板进行查询:Cell search和Marker search。 (1)Cell search 按照下图所示,依次选择物种,组织,细胞类型来搜索目标细胞的细胞标志物。 结果如下: (2)Marker search 选择物种后,我们可以通过输入基因名称,基因ID或蛋白质名称来搜索感兴趣的基因,以查询特定基因可以在哪些组织的哪些细胞类型中充当细胞...
我们可以使用CellMarker查找特定组织或细胞类型对应的marker,反过来,我们也可以通搜索细胞亚群的top genes确定细胞类型。 数据库链接: http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/CellMarker/ http://117.50.127.228/CellMarker/ 教程链接: 《一个快速完成细胞分群的免费网站》 2 PCMDB PCMDB(Plant Cell Marker Data Base),...
CellMarker 数据库http://biocc.hrbmu.edu.cn/CellMarker/或者http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/CellMarker/,旨在提供一个全面准确的资源 人和小鼠组织中各种细胞类型的细胞标记物。 通过人工整理超过 10 万篇已发表论文,记录了 4124 个条目,包括细胞标记信息、组织类型、细胞类型、癌症信息和来源。 最后,收集了...
CellMarker数据库于2019年1月在Nucleic Acids Research期刊发表，收录了158种组织/亚组织的人细胞类型和81种组织/亚组织的鼠细胞类型。数据主要来源于文献和数据库，包括单细胞测序数据和生物实验数据。CellMarker数据库包含丰富的人和鼠细胞类型信息，用户可快速查找细胞和组织的标志物。例如，点击Human的...
CellMarker数据库是科研界重要的资源，由哈尔滨医科大学Yun Xiao等老师在2019年发布。该数据库以核酸研究(Nucleic Acids Research)为平台，整合了超过10万篇文献，涵盖了人类158个组织亚组织的467个细胞类型，以及鼠类81个组织亚组织的389个细胞类型。研究团队精心筛选出13,605个人类Marker基因和9,148个鼠类...
“Search”功能允许你通过细胞搜索或标记物搜索来查找目标细胞或特定基因的使用情况。无论是按照组织、细胞类型一步步筛选，还是直接输入基因名称，都能获得详尽的结果，如交互式气泡图和包含频率信息的表格。最后，“Download”选项允许你下载数据库的TXT格式文件，获取所有细胞标志物数据。CellMarker数据库简洁...
CellMarker: a manually curated resource of cell markers in human and mouse.Nucleic Acids Research. 2018. 11.GPA GPA简介 基因微扰图谱(GPA):一个单基因微扰资源库,用于描述编码和非编码基因的功能机制特征。 (GPA)数据库全面收集了蛋白质编码基因、miRNA和lncRNA(transcriptome profiles of protein coding gene...
00:00/00:00 Cell Marker与PanglaoDB数据库-欧易生物 欧易生物2020.11.09 15:04 分享到 欧易生物单细胞事业部出品,本次为您带来辅助单细胞细胞类型鉴定的2个数据库—Cell Marker与PanglaoDB使用说明教程。