使用Monocle2软件进行细胞轨迹分析,确定了CD8+ T细胞亚型存在四个不同的转录状态,其中CD8增殖T细胞主要处于细胞周期活跃的早期阶段;CD8 GZMB+处于中间阶段;而CD8 GZMK+则集中在最终阶段,并具有最高的细胞毒性和最低的衰竭水平。 研究还揭示了这三种CD8+ T细胞亚型在GOLP治疗后的功能状态变化。良好的治疗反应与CD8+ T...
同时,GZMK-GZMB+T细胞在PBMC中富集。这些结果表明HGG TIL中的大多数CD8+T细胞为GZMK+,可独立于TEMRA细胞状态发展。 其次,在其它脑部恶性肿瘤,包括不同组织学类型的脑转移瘤中,作者也发现了一定比例的GZMK+T细胞(13.7%),表明GZMK+T细...
同时,GZMK-GZMB+T细胞在PBMC中富集。这些结果表明HGG TIL中的大多数CD8+T细胞为GZMK+,可独立于TEMRA细胞状态发展。 其次,在其它脑部恶性肿瘤,包括不同组织学类型的脑转移瘤中,作者也发现了一定比例的GZMK+T细胞(13.7%),表明GZMK+T细胞的存在并不局限于HGG。鉴于GZMK+T细胞在CD8+TIL中占很大比例,作者整合了来自20种...
Dunn、布列根和妇女医院Tanner Johanns联合在Cancer discovery期刊上发表题为Glioblastoma-infiltrating CD8+ T cells are predominantly a clonally expanded GZMK+ effector population的研究论文,使用多组学方法对脑胶质瘤患者的T细胞进行测序,发现典型的T细胞耗竭标志在高级别胶质瘤(HGG)的TIL中弱表达。值得注意的是,在...
在前面提到过的其中一项黑色素瘤研究中,这些功能障碍前的细胞(称为“过渡细胞”)可由GZMK的高表达和PDCD1、LAG3等的中等水平表达所定义(Li et al., 2019)。在Sade-Feldman et al.这项研究的黑色素瘤队列中,研究者发现了一个表达...
CD8功能基因集中的基因包括但不限于CD8A、CD8B、PRF1、GZMA、GZMB、GZMK等。这些基因在调节CD8+T细胞的杀伤能力、增殖能力、细胞凋亡等方面发挥着重要的作用。 CD8功能基因集中的CD8A和CD8B基因编码CD8分子的α链和β链,这两个基因在CD8+T细胞的免疫应答中起到了关键的作用。CD8A和CD8B基因的表达水平与CD8+T细胞的...
接下来,研究人员利用Monocle3揭示了CD8+T细胞从初级CD8_SELL细胞开始,通过以CD8_GZMK细胞为特征的中间状态,最终到达两个独立的终端谱系(终末分化T细胞,TEMRA),分别是CD8_GZMB和CD8_GZMH。基因差异表达(DEG)分析表明,CD8_GZMB细胞高表达“T细胞活化”、“T细胞受体信号通路”相关基因,而CD8_GZMH细胞则高表达CD161、...
相比之下,晚期阶段具有相同抗原特异性的CD8 T细胞则表达了与自我更新相关的基因,如TCF7和IL7R,以及干细胞特性(GZMK)。将这些数据与公开的HIV特异性CD8 T细胞转录组数据集进行比较,结果显示早期阶段的CD8 T细胞特征与慢性进展者中的CD8 T细胞相似,而晚期阶段的CD8 T细胞则更类似于HIV-1感染自然控制者中的CD8 T细胞...
接下来,研究人员利用Monocle3揭示了CD8+T细胞从初级CD8_SELL细胞开始,通过以CD8_GZMK细胞为特征的中间状态,最终到达两个独立的终端谱系(终末分化T细胞,TEMRA),分别是CD8_GZMB和CD8_GZMH。基因差异表达(DEG)分析表明,CD8_GZMB细胞高表达“T细胞活化”、“T细胞受体信号通路”相关基因,而CD8_GZMH细胞则高表达CD161、...
在这里,我们对来自抗瓜氨酸蛋白抗体(ACPA)+RA血液的CD8+T细胞进行单细胞转录组和T细胞受体(TCR)测序。我们确定GZMB+CD8+亚群包含表达细胞毒性和组织归巢转录程序的大型克隆性谱系扩展,而GZMK+CD8+记忆亚群包含表达效应性T细胞转录程序的较小克隆性扩展。我们证明了由MHC I类提呈的RA瓜氨酸自身抗原可以激活RA血源性GZMB...